55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1535 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  100 
 
 
588 aa  1192    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3452  hypothetical protein  24.57 
 
 
519 aa  71.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  27.33 
 
 
495 aa  68.2  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.01 
 
 
573 aa  61.6  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0681  hypothetical protein  21.29 
 
 
619 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.98 
 
 
578 aa  58.2  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.36 
 
 
616 aa  57.4  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.24 
 
 
603 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25 
 
 
579 aa  55.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.71 
 
 
608 aa  54.3  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.88 
 
 
550 aa  53.9  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  25.56 
 
 
688 aa  53.9  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.57 
 
 
595 aa  53.9  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.69 
 
 
652 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  27.92 
 
 
628 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.74 
 
 
634 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  23.81 
 
 
497 aa  52.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.27 
 
 
613 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  23.21 
 
 
642 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.05 
 
 
615 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  24.47 
 
 
654 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  29.35 
 
 
564 aa  48.9  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  30.56 
 
 
276 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  30.17 
 
 
648 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0319  cobalt transporter ATP-binding subunit  25.9 
 
 
288 aa  48.9  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.2074000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  27.81 
 
 
600 aa  47.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  30.19 
 
 
513 aa  47.8  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.52 
 
 
589 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05008  hypothetical protein  24.49 
 
 
658 aa  47.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  23.37 
 
 
586 aa  47.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  39.62 
 
 
626 aa  47.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  29.25 
 
 
505 aa  47.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2479  ABC transporter related  23.12 
 
 
339 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  26.47 
 
 
431 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  50 
 
 
426 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  37.5 
 
 
494 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.29 
 
 
708 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  22.55 
 
 
771 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  40.38 
 
 
626 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  24.59 
 
 
441 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  21.13 
 
 
606 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4672  ABC transporter, ATP-binding protein  29.57 
 
 
219 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  25 
 
 
703 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  43.75 
 
 
663 aa  45.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.1 
 
 
642 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  45.83 
 
 
626 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  26.27 
 
 
584 aa  44.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.5 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  29.85 
 
 
666 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4759  ABC transporter related  28.57 
 
 
219 aa  44.3  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  46.51 
 
 
369 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5049  ABC transporter, ATP-binding protein  27.78 
 
 
219 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  23.76 
 
 
604 aa  43.9  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4652  ABC transporter, ATP-binding protein  27.78 
 
 
219 aa  43.9  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  18.98 
 
 
607 aa  43.9  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>