211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2646 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  100 
 
 		 374 aa  738    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  51.34 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.69 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  29.47 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  28.61 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  25.68 
 
 		 410 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  25.13 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  27.73 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  28.53 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  27.2 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 		 386 aa  122  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  27.69 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  27.73 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  26.46 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  26.65 
 
 		 380 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  25.56 
 
 		 392 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  27.78 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  25.74 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 378 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  27.51 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  27.51 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  27.51 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  27.51 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 		 378 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 		 378 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  25.99 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  26.7 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  26.26 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  26.26 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  24.35 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  25.8 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  23.13 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  25.86 
 
 		 384 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 406 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  24.74 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  23.87 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1398  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 		 397 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00210458  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.55 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  24.61 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  24.6 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  24.67 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  23.56 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  24.53 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  26.15 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  24.09 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  25.19 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  23.42 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 833 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  23.21 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  22.45 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  22.45 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  22.45 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  23.75 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  20.44 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  22.19 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  28.46 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  23.21 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  22.19 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  22.98 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  30.47 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  22.34 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  21.73 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  23.46 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  27.89 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  22.28 
 
 		 378 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  27.91 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  29.46 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  21.51 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  27.56 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.51 
 
 		 417 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  20.26 
 
 		 389 aa  53.5  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  26.09 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  23.62 
 
 		 390 aa  53.5  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 		 349 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  23.88 
 
 		 381 aa  53.1  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  28.3 
 
 		 420 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  31.2 
 
 		 356 aa  53.1  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  21.17 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  20.11 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.24 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  23.89 
 
 		 808 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  28.8 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  24.83 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  30.2 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.08 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  28.8 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  29.46 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  24.87 
 
 		 400 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2729  protein of unknown function DUF214  30.95 
 
 		 796 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  29.46 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  22.7 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.93 
 
 		 852 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  29.91 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.37 
 
 		 411 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  31.68 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>