More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1763 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  70.11 
 
 		 545 aa  810    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.96 
 
 		 645 aa  677    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  74.45 
 
 		 544 aa  863    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 546 aa  1115    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  50.37 
 
 		 637 aa  571  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  50.73 
 
 		 630 aa  567  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  49.63 
 
 		 643 aa  554  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  44.11 
 
 		 649 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  43.12 
 
 		 649 aa  445  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 		 645 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  41.95 
 
 		 645 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  41.35 
 
 		 690 aa  415  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  40.73 
 
 		 575 aa  418  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  39.3 
 
 		 668 aa  414  1e-114  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  40.41 
 
 		 564 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  40.64 
 
 		 641 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  41.34 
 
 		 581 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  40.73 
 
 		 664 aa  411  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  41.41 
 
 		 709 aa  403  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  41.89 
 
 		 648 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  40.95 
 
 		 569 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  41.54 
 
 		 567 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  39.31 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 767 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  41.51 
 
 		 648 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  41.54 
 
 		 564 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  40.78 
 
 		 653 aa  395  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 		 632 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  39.93 
 
 		 651 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  40.51 
 
 		 650 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  40.15 
 
 		 638 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  42.01 
 
 		 642 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  40.3 
 
 		 656 aa  388  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  40.04 
 
 		 574 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  40.57 
 
 		 650 aa  382  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  38.53 
 
 		 652 aa  385  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  40.07 
 
 		 641 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  39.31 
 
 		 656 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  39.7 
 
 		 641 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  38.8 
 
 		 545 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  37.9 
 
 		 646 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  38.84 
 
 		 672 aa  377  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0373  ATPase  40.3 
 
 		 583 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  40.43 
 
 		 574 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  38.35 
 
 		 685 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  38.58 
 
 		 667 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  38.55 
 
 		 652 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  37.7 
 
 		 644 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  37.28 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  37.28 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  40.3 
 
 		 542 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 		 663 aa  369  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  37.52 
 
 		 540 aa  369  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  37.93 
 
 		 548 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 663 aa  368  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  37.36 
 
 		 667 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  37.2 
 
 		 635 aa  366  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  36.9 
 
 		 540 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  38.39 
 
 		 572 aa  365  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  38.34 
 
 		 572 aa  362  8e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  37.25 
 
 		 549 aa  362  9e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  34.88 
 
 		 688 aa  362  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 		 636 aa  361  2e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  38.52 
 
 		 544 aa  359  6e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 		 545 aa  359  8e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  36.4 
 
 		 541 aa  359  8e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  37.74 
 
 		 543 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  37.67 
 
 		 539 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  38.95 
 
 		 639 aa  355  1e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  36.66 
 
 		 548 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  36.8 
 
 		 545 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  37.38 
 
 		 619 aa  353  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  36.48 
 
 		 540 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  37.28 
 
 		 540 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  36.47 
 
 		 548 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  37.14 
 
 		 540 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  34.58 
 
 		 659 aa  350  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 		 540 aa  350  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0405  ABC transporter related protein  36.45 
 
 		 658 aa  350  4e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224406  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  36.76 
 
 		 560 aa  350  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  37.28 
 
 		 540 aa  349  8e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  36.71 
 
 		 540 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  37.57 
 
 		 575 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  35.82 
 
 		 541 aa  348  2e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  37.09 
 
 		 540 aa  348  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  34.45 
 
 		 634 aa  348  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  36.91 
 
 		 639 aa  347  3e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.52 
 
 		 541 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  36.69 
 
 		 540 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  35.01 
 
 		 536 aa  346  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  37.14 
 
 		 540 aa  346  7e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  38.05 
 
 		 543 aa  346  8e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1403  ABC transporter, ATP-binding protein  38.76 
 
 		 667 aa  345  8.999999999999999e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  36.13 
 
 		 540 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  36.95 
 
 		 565 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  38.42 
 
 		 638 aa  345  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  36.52 
 
 		 540 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  38.03 
 
 		 643 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  37.43 
 
 		 536 aa  343  4e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 644 aa  343  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>