More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0103 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 421 aa  837    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  76.25 
 
 		 421 aa  664    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  76.48 
 
 		 421 aa  664    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0078  preprotein translocase subunit SecY  78.15 
 
 		 420 aa  672    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  76.48 
 
 		 421 aa  666    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1949  preprotein translocase, SecY subunit  76.96 
 
 		 420 aa  676    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0053  preprotein translocase subunit SecY  81 
 
 		 420 aa  677    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0305  preprotein translocase subunit SecY  68.88 
 
 		 420 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1757  preprotein translocase subunit SecY  78.19 
 
 		 352 aa  547  1e-154  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  43.55 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  44.28 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  42.58 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  42.09 
 
 		 435 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  43.58 
 
 		 437 aa  364  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 		 435 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  41.73 
 
 		 444 aa  364  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  42.58 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  41.79 
 
 		 437 aa  360  4e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  41.36 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  42.51 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  41.73 
 
 		 443 aa  352  5e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  41.73 
 
 		 443 aa  352  5e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  41.9 
 
 		 437 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  41.85 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  42.69 
 
 		 437 aa  349  6e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  41.61 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  42.62 
 
 		 447 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  43.41 
 
 		 435 aa  340  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  40.38 
 
 		 434 aa  340  4e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  40.49 
 
 		 440 aa  340  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  42.37 
 
 		 447 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0271  preprotein translocase, SecY subunit  47.96 
 
 		 430 aa  339  4e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.523157  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  43.6 
 
 		 442 aa  338  8e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  43.86 
 
 		 448 aa  338  9e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  40 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  40.38 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  40 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  40.32 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  40.14 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  43.34 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  40.62 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  39.9 
 
 		 446 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  40.91 
 
 		 441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  40.38 
 
 		 453 aa  335  5.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  42.13 
 
 		 447 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  40.51 
 
 		 443 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  40.51 
 
 		 443 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  40.51 
 
 		 443 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  40.51 
 
 		 443 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  40.24 
 
 		 442 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  40.24 
 
 		 442 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.21 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2149  preprotein translocase, SecY subunit  43.47 
 
 		 448 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0576412  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  39.37 
 
 		 437 aa  332  6e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  41.05 
 
 		 445 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  40.53 
 
 		 445 aa  332  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  41.87 
 
 		 437 aa  332  9e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  40.77 
 
 		 441 aa  331  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  39.76 
 
 		 442 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  38.85 
 
 		 440 aa  331  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 		 443 aa  330  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  40.62 
 
 		 439 aa  330  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  41.77 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  39.9 
 
 		 446 aa  330  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  39.95 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  39.48 
 
 		 437 aa  329  6e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  41.53 
 
 		 446 aa  328  8e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  39.29 
 
 		 446 aa  328  8e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  39.95 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  41.53 
 
 		 446 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  41.35 
 
 		 443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  39.85 
 
 		 443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  39.72 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  40.38 
 
 		 446 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  39.67 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0838  preprotein translocase subunit SecY  41.79 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  39.67 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  40.09 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  39.45 
 
 		 436 aa  323  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  40.87 
 
 		 444 aa  322  8e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  39.7 
 
 		 436 aa  322  8e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  42 
 
 		 448 aa  321  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  40.72 
 
 		 448 aa  321  9.999999999999999e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  39.67 
 
 		 446 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  39.67 
 
 		 446 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  39.67 
 
 		 446 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  41.77 
 
 		 443 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  41.05 
 
 		 446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04500  preprotein translocase subunit SecY  39.52 
 
 		 454 aa  319  6e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.705639  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  41.15 
 
 		 443 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  40.05 
 
 		 440 aa  319  6e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  37.74 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0776  preprotein translocase subunit SecY  38.72 
 
 		 455 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  0.028717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  38.24 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2304  preprotein translocase subunit SecY  42.61 
 
 		 451 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  39.19 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  37.5 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000317062  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  37.97 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  37.97 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>