More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0043 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  100 
 
 
330 aa  679  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  79.7 
 
 
330 aa  563  1e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  80.61 
 
 
330 aa  560  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  78.38 
 
 
333 aa  544  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  76.67 
 
 
323 aa  535  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  76.06 
 
 
323 aa  536  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  76.97 
 
 
323 aa  536  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  76.97 
 
 
323 aa  536  1e-151  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  74.32 
 
 
329 aa  520  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  66.67 
 
 
324 aa  462  1e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.67 
 
 
277 aa  205  7e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.04 
 
 
284 aa  196  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  39.69 
 
 
291 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.69 
 
 
291 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  3.42519e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.81 
 
 
293 aa  189  6e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.67 
 
 
284 aa  189  6e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.57708e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.67 
 
 
284 aa  189  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.8 
 
 
309 aa  185  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.34 
 
 
294 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.34 
 
 
294 aa  185  1e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.95 
 
 
306 aa  183  4e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.58 
 
 
296 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.63 
 
 
309 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  36.25 
 
 
312 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.66 
 
 
286 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.50727e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.8 
 
 
298 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.19 
 
 
344 aa  173  4e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.81 
 
 
300 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.76 
 
 
329 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.31 
 
 
283 aa  166  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.55 
 
 
288 aa  165  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  33.94 
 
 
285 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.73 
 
 
290 aa  163  4e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.54 
 
 
286 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.44062e-15  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.44 
 
 
291 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  2.25432e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.67 
 
 
277 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.37 
 
 
276 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.62 
 
 
280 aa  156  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.38 
 
 
281 aa  152  6e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.44 
 
 
278 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.92 
 
 
281 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.06 
 
 
281 aa  147  2e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  28.53 
 
 
331 aa  139  5e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  29.72 
 
 
338 aa  128  1e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  27.89 
 
 
333 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  27.24 
 
 
328 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  42.54 
 
 
182 aa  106  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.86 
 
 
137 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  41.35 
 
 
128 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  42.11 
 
 
149 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  42.11 
 
 
124 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  41.35 
 
 
128 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  41.35 
 
 
125 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  40.82 
 
 
153 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.43 
 
 
142 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  43.61 
 
 
139 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0302  scaffold protein  42.86 
 
 
142 aa  98.2  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  44.36 
 
 
130 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  6.68017e-07 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  37.34 
 
 
144 aa  97.4  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.71 
 
 
138 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.53527e-10  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04655  iron-sulfur cofactor synthesis protein (Isu1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06770)  39.23 
 
 
173 aa  97.1  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.593219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  42.54 
 
 
153 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  40.15 
 
 
127 aa  95.9  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.27457e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  41.79 
 
 
153 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  41.79 
 
 
153 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  38.57 
 
 
143 aa  95.9  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  40 
 
 
144 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  40 
 
 
142 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  39.55 
 
 
124 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  4.51937e-06 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  40 
 
 
145 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1478  scaffold protein  40.3 
 
 
128 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.671651  hitchhiker  0.00720513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  39.1 
 
 
123 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  40.6 
 
 
127 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.68917e-05  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  36.88 
 
 
129 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  39.19 
 
 
150 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.6 
 
 
143 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  42.54 
 
 
127 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  40.6 
 
 
143 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  39.55 
 
 
127 aa  93.6  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  3.3e-05 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  41.35 
 
 
135 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  39.55 
 
 
126 aa  93.2  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  37.59 
 
 
133 aa  93.2  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  39.39 
 
 
143 aa  93.2  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  37.74 
 
 
153 aa  93.2  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  38.35 
 
 
139 aa  92.8  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  39.1 
 
 
127 aa  92.8  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  1.93406e-08 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  40.3 
 
 
127 aa  92.8  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  38.35 
 
 
132 aa  92.8  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  37.59 
 
 
132 aa  92.8  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  38.35 
 
 
138 aa  92.8  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  39.85 
 
 
127 aa  92.4  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  39.1 
 
 
128 aa  92.4  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  92.4  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  41.35 
 
 
128 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  41.35 
 
 
128 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  1.35167e-09 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  40.3 
 
 
127 aa  92  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  41.35 
 
 
128 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  41.35 
 
 
128 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>