More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12393 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12393  Glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
336 aa  684    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
368 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
370 aa  113  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
376 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.17 
 
 
360 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 
768 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 
365 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.63 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  29.76 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  22.09 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  26.07 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
439 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
406 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
412 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
433 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  25.36 
 
 
382 aa  75.9  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2859  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2027  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  36.46 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.71 
 
 
371 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
387 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1267  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0583334  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  24.25 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  27.15 
 
 
471 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  23.9 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.92 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
518 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  22.87 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
412 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  21.83 
 
 
419 aa  69.3  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  22.79 
 
 
400 aa  69.3  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 
430 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  21.83 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  23.64 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  22.12 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  21.86 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  22.52 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0564  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  25.65 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.11 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  26.02 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
427 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.03 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  24.9 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
379 aa  67  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
356 aa  67  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
394 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 
660 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.32 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
507 aa  66.6  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  22.94 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
903 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1916  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  22.5 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
1177 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
468 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>