More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10768 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.15 
 
 		 267 aa  361  9e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.47 
 
 		 273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  47.76 
 
 		 272 aa  256  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.11 
 
 		 266 aa  232  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.94 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  38.57 
 
 		 277 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 278 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.74 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  36.06 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  40.66 
 
 		 284 aa  169  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  36 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  36.98 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.64 
 
 		 280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 		 273 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.07 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  35.62 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  45.29 
 
 		 268 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  39.65 
 
 		 268 aa  159  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.32 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.74 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.42 
 
 		 273 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  34.57 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  34.05 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.21 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  37.09 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 276 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 267 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 279 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  33.81 
 
 		 276 aa  148  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 300 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.69 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.39 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  41.85 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 		 281 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 		 276 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  33.94 
 
 		 847 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 		 286 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 		 282 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  41.44 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 268 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  42.63 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  36.52 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  35.97 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  43.62 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 268 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 272 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 		 277 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>