More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0037 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  100 
 
 
276 aa  557  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  27.57 
 
 
277 aa  115  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
283 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.83 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 
264 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 
291 aa  108  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 
275 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 
295 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 
287 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 
381 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 
288 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
265 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  31.39 
 
 
273 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
361 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
345 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.55 
 
 
266 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  30 
 
 
279 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 
296 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
285 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  33.92 
 
 
301 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 
314 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 
350 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
288 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 
282 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 
284 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 
289 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
283 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
283 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  27.94 
 
 
283 aa  99.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
284 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.04 
 
 
262 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
288 aa  99  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
275 aa  99  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  34.81 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  29.89 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 
287 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
254 aa  96.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
284 aa  96.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  32.83 
 
 
315 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  32.83 
 
 
315 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
287 aa  96.3  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
277 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 
281 aa  95.9  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
288 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
288 aa  95.5  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
274 aa  95.5  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 
302 aa  95.5  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  32.61 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  27.85 
 
 
331 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  29.96 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
331 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  34.78 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  32.01 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
287 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.08 
 
 
372 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
287 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  28.36 
 
 
279 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.39 
 
 
371 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
253 aa  94  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
279 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.265351 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.92 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.92 
 
 
288 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  27.92 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.92 
 
 
288 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  30 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.92 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.92 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
288 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
293 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  28.57 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  28 
 
 
279 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  28 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
270 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  31.97 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  32.38 
 
 
275 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.61 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>