64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7298 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  100 
 
 		 548 aa  1135    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  29.56 
 
 		 557 aa  150  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1283  hypothetical protein  27.32 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  31.45 
 
 		 660 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2729  hypothetical protein  30.81 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000436678  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5396  hypothetical protein  30.41 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613339  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  28.12 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4966  hypothetical protein  30.41 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  29.1 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3661  hypothetical protein  29.35 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  35.26 
 
 		 658 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3689  hypothetical protein  27.17 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  34.12 
 
 		 254 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  30.12 
 
 		 187 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  32.1 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  30.12 
 
 		 187 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0070  hypothetical protein  28.49 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000494627  decreased coverage  0.00000000181014 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  30.12 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2891  hypothetical protein  26.94 
 
 		 277 aa  67  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.458702  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  27.81 
 
 		 569 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1409  hypothetical protein  26.2 
 
 		 280 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.180629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3416  hypothetical protein  25.26 
 
 		 281 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03540  conserved hypothetical protein  24.87 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03483  hypothetical protein  24.87 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2239  hypothetical protein  25.67 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4673  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0060  hypothetical protein  29.63 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.218485  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3215  hypothetical protein  25 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  32 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  33.05 
 
 		 1412 aa  64.3  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1380  hypothetical protein  25.13 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.966548  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  30.86 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  36.76 
 
 		 1425 aa  59.3  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  30.21 
 
 		 1451 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3129  hypothetical protein  21.72 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.03549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0746  hypothetical protein  20.6 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  38.46 
 
 		 1414 aa  57.4  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3355  hypothetical protein  22.63 
 
 		 280 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  37.59 
 
 		 1463 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  34.01 
 
 		 824 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0478  hypothetical protein  21.35 
 
 		 277 aa  53.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5014  hypothetical protein  28.34 
 
 		 597 aa  51.6  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  34.51 
 
 		 684 aa  51.2  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1768  hypothetical protein  22.87 
 
 		 277 aa  50.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000246433  hitchhiker  0.00548323 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  36.43 
 
 		 1458 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  32.65 
 
 		 1413 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  36.48 
 
 		 1440 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  35.71 
 
 		 1396 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  36.43 
 
 		 1448 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  35.29 
 
 		 1449 aa  48.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  37.5 
 
 		 1440 aa  48.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  38.98 
 
 		 1455 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  34.75 
 
 		 1444 aa  47.4  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  37.5 
 
 		 1437 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  36.88 
 
 		 1447 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  38.33 
 
 		 1444 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02762  hypothetical protein  22.84 
 
 		 189 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  37.29 
 
 		 515 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02811  conserved hypothetical protein  22.84 
 
 		 189 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  36.21 
 
 		 1440 aa  44.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  37.61 
 
 		 1439 aa  43.5  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  37.61 
 
 		 1439 aa  43.5  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5345  hypothetical protein  31.5 
 
 		 375 aa  43.5  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.827686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>