More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5427 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  100 
 
 
490 aa  980    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  45.31 
 
 
511 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  44.6 
 
 
507 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  43.56 
 
 
513 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  41.34 
 
 
569 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  44.2 
 
 
507 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  44.2 
 
 
507 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.66 
 
 
515 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 
506 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 
506 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  43.99 
 
 
506 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  43.99 
 
 
506 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  43.27 
 
 
502 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
509 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
502 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
502 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  44.95 
 
 
507 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  44.2 
 
 
506 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 
501 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  44.95 
 
 
507 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.97 
 
 
501 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  44.95 
 
 
507 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  43.78 
 
 
523 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
503 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
506 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  42.65 
 
 
503 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  42.75 
 
 
521 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
502 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  42.24 
 
 
502 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  41.01 
 
 
520 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  43.03 
 
 
509 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  43.18 
 
 
504 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.54 
 
 
507 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.3 
 
 
497 aa  361  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
564 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  41.86 
 
 
561 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
546 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
564 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.2 
 
 
501 aa  359  6e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  42.58 
 
 
497 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
501 aa  356  5.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  42.17 
 
 
501 aa  356  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 
564 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  41.09 
 
 
564 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
501 aa  354  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.6 
 
 
503 aa  352  8e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  43.69 
 
 
495 aa  350  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  40.63 
 
 
562 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.92 
 
 
495 aa  343  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
492 aa  340  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.92 
 
 
494 aa  334  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  39.75 
 
 
488 aa  333  5e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 
492 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  38.13 
 
 
499 aa  327  3e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  43.97 
 
 
492 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  42.8 
 
 
496 aa  316  6e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  43.37 
 
 
492 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.59 
 
 
489 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 
490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  43.16 
 
 
488 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
511 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
502 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
502 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
502 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
498 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  42.47 
 
 
502 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
486 aa  298  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
502 aa  296  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  37.45 
 
 
502 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  42.47 
 
 
502 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.86 
 
 
491 aa  289  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  38.46 
 
 
495 aa  286  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.67 
 
 
494 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
488 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
501 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
507 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  36.38 
 
 
520 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
493 aa  280  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
490 aa  279  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  37.14 
 
 
488 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
488 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
488 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  35.7 
 
 
520 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.13 
 
 
507 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 
470 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  37.12 
 
 
487 aa  276  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1588  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 
485 aa  272  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104897  hitchhiker  0.00377444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
517 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  37.26 
 
 
515 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38 
 
 
471 aa  269  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  36.07 
 
 
508 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.64 
 
 
464 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
491 aa  268  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
477 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.78 
 
 
472 aa  266  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
485 aa  266  7e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
470 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.4 
 
 
485 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  37.9 
 
 
498 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>