More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1963 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1963  porin  100 
 
 		 372 aa  745    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.513284 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5110  porin Gram-negative type  52.42 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2720  OmpC family outer membrane porin  52.84 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  35.5 
 
 		 350 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  36.07 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  36.07 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  36.1 
 
 		 350 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6530  outer membrane protein, (porin)-like  31.75 
 
 		 417 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  33.77 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  30 
 
 		 350 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  32.3 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  33.51 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  33.51 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  33.51 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  33.25 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  32.42 
 
 		 383 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4766  porin  32.51 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3601  porin  32.51 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5517  porin  32.51 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  31.87 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  31.87 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  31.87 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  31.79 
 
 		 362 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  31.07 
 
 		 383 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5897  outer membrane protein (porin)-like protein  32.6 
 
 		 390 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0466663 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  33.07 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  30.62 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  33.24 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  33.24 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  33.07 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  33.24 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  30.52 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  30.17 
 
 		 383 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  31.44 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  32.8 
 
 		 383 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  32.37 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  32.17 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  32.29 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  30.54 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  30.93 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  29.77 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  30.88 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0949  outer membrane protein (porin)-like  34.88 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  31.07 
 
 		 383 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  31.07 
 
 		 374 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  31.96 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  31.7 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  31.19 
 
 		 381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  32.62 
 
 		 375 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  30.89 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  29.44 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  29.72 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  28.47 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  31.07 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  31.07 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  33.42 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  33.42 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  30.32 
 
 		 335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  32.32 
 
 		 355 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  29.9 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  33.42 
 
 		 376 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  29.9 
 
 		 379 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  29.9 
 
 		 379 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  29.9 
 
 		 379 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  30.46 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  30.35 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  31.09 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  29.64 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  30.81 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  31.95 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  37.7 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  31.14 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  30.81 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  31 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  30 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  30 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  31.23 
 
 		 496 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  32.28 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  30 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  30 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  30.54 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  30.95 
 
 		 523 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  31.57 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  30 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  31.68 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  33.24 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  30.98 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  30.05 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  29.63 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  29.63 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  31.25 
 
 		 383 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  29.41 
 
 		 385 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  31.4 
 
 		 386 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  32.28 
 
 		 398 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  29.26 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  29.26 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  29.26 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  29.26 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  31.62 
 
 		 374 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  30.54 
 
 		 396 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>