More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0213 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0213  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718825  unclonable  0.0000000000104245 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0237  LysR family transcriptional regulator  87.17 
 
 		 306 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618389  unclonable  0.0000000000250683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0229  LysR family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 306 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00000000369009  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3409  LysR family transcriptional regulator  85.53 
 
 		 309 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000205674  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0290  LysR family transcriptional regulator  86.14 
 
 		 309 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000353581  unclonable  0.0000000000404999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2796  LysR family transcriptional regulator  85.48 
 
 		 309 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000015017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0310  LysR family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 292 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3798  LysR family transcriptional regulator  79.53 
 
 		 312 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0027  transcriptional regulatory protein  79.53 
 
 		 312 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000739069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3859  LysR family transcriptional regulator  79.53 
 
 		 312 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000387155  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3119  transcriptional regulatory protein  79.19 
 
 		 312 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234841  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1243  LysR family transcriptional regulator  67.57 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1794  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30450  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3600  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.33 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326456  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2539  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3227  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1550  transcriptional regulator, LysR family  39.67 
 
 		 303 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.93213 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30980  Transcriptional regulator LysR family protein  39.13 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21680  Transcriptional regulator, LysR family  39.48 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291756  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4155  LysR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532001  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1913  LysR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4332  LysR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.192569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1753  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0990804  normal  0.117746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4108  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4258  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000322275  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3259  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3682  LysR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5230  LysR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 212 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957267  normal  0.114688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0456  LysR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0935  LysR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0897  LysR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536186  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4600  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4118  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 324 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00686854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4037  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0044  LysR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2999  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0222348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6254  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4822  putative transcriptional regulatory protein (nitrogen assimilation control protein)  26.88 
 
 		 331 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.672498  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3833  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  29.3 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0330  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 288 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 288 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 288 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.57 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3781  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 331 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.852232  normal  0.126897 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  28.63 
 
 		 288 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3264  transcriptional regulator, LysR family  26.35 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  28.63 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3715  LysR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0709  transcriptional regulator OxyR, putative  29.96 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  28.63 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1974  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168317  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1345  transcriptional regulator, LysR family  33.61 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3038  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000600808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1472  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3271  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1473  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1497  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2404  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 311 aa  92.4  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1688  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0165  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1351  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04591  oxidative stress transcriptional regulator  30.41 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4731  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2959  LysR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0355  hypothetical protein  25.65 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0665  putative transcriptional regulator OxyR  29.59 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2037  transcriptional regulator, LysR family  30.68 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0223119  hitchhiker  0.000202643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  32.7 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3114  transcriptional regulator, LysR family  28.29 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2176  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  26.62 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  33.08 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0464  transcriptional regulator, LysR family  27.86 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>