More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0097 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  100 
 
 		 393 aa  784    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  58.27 
 
 		 392 aa  408  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  47.83 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  49.36 
 
 		 391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  47.16 
 
 		 390 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  47.42 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  49.74 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  48.59 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  49.73 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  46.91 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  48.59 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 387 aa  288  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  45.65 
 
 		 387 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  48.84 
 
 		 388 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  48.45 
 
 		 424 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  42.75 
 
 		 386 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  43.83 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  43.31 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  43.31 
 
 		 392 aa  276  6e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  43.83 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  42.53 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  46.58 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  44.35 
 
 		 402 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  47.2 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  42.82 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  47.23 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  38.14 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  43.77 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  45.5 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  42.03 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  35.99 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  39.64 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 533 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  40.32 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  38.92 
 
 		 385 aa  219  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  36.46 
 
 		 401 aa  219  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  35.49 
 
 		 401 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  38.6 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1241  aminotransferase, class V  41.27 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  43.01 
 
 		 381 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  39.9 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  40.77 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  35.28 
 
 		 401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  31.84 
 
 		 492 aa  212  7.999999999999999e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  39.45 
 
 		 1139 aa  212  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3963  cysteine desulfurase  40.52 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0421265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  35.38 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  37.11 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  39.48 
 
 		 391 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  35.68 
 
 		 398 aa  210  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  36.63 
 
 		 396 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  39.33 
 
 		 416 aa  209  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  35.04 
 
 		 398 aa  209  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  38.44 
 
 		 422 aa  209  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  39.79 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  38.82 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  34.55 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  40.52 
 
 		 400 aa  206  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  39.51 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  42.47 
 
 		 381 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  39.01 
 
 		 386 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  39.89 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  38.86 
 
 		 1143 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  34.04 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  33.92 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  37.31 
 
 		 1135 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  32.74 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1632  cysteine desulfurase  40.26 
 
 		 348 aa  202  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.422734  hitchhiker  0.00000261738 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  40.31 
 
 		 373 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  41.34 
 
 		 385 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  41.94 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  41.73 
 
 		 391 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  37.53 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  34.35 
 
 		 384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  39.45 
 
 		 419 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  34.3 
 
 		 400 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  38.21 
 
 		 390 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  32.56 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  34.55 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  32.56 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  38.42 
 
 		 397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  39.07 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  38.42 
 
 		 397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  37.47 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  38.15 
 
 		 397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  34.63 
 
 		 381 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0442  putative aminotransferase  41.99 
 
 		 348 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0429876  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  34.79 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  38.76 
 
 		 407 aa  196  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  33.86 
 
 		 392 aa  196  9e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  34.48 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  38.66 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  34.88 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  37.84 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0304  rrf2/aminotransferase, class V family protein  34.55 
 
 		 530 aa  194  2e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2365  aminotransferase, class V  38.96 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.494188 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  35.14 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  37.73 
 
 		 401 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  34.37 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  33.33 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>