80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26830 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  972    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  45.11 
 
 		 589 aa  351  1e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  45.77 
 
 		 545 aa  330  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  42.23 
 
 		 541 aa  286  8e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  35.28 
 
 		 555 aa  180  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  34.68 
 
 		 594 aa  176  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  35.85 
 
 		 479 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  35.5 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  35.22 
 
 		 457 aa  161  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  33.43 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  33.6 
 
 		 434 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  33.6 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  30.59 
 
 		 547 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  33.6 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  34.85 
 
 		 411 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  34.58 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  33.85 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  34.58 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  33.42 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  33.42 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  33.94 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  30.79 
 
 		 426 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  32.24 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  32.19 
 
 		 430 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  31.01 
 
 		 437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  30.91 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  30.37 
 
 		 436 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  31.45 
 
 		 430 aa  130  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  29.95 
 
 		 403 aa  124  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  31.72 
 
 		 466 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  30.87 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  28.73 
 
 		 404 aa  120  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  30.03 
 
 		 405 aa  120  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  29.03 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  29.58 
 
 		 481 aa  117  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  34.87 
 
 		 268 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  29.48 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  35.96 
 
 		 256 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  27.75 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  32.37 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  24.94 
 
 		 508 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  25.65 
 
 		 516 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  27.03 
 
 		 567 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  26.71 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  25.79 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  28.36 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  28.12 
 
 		 556 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  28.35 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  28.09 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  25.13 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  29.51 
 
 		 628 aa  57  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  28.22 
 
 		 580 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  26.56 
 
 		 535 aa  54.3  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  22.68 
 
 		 566 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  23.74 
 
 		 507 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  23.71 
 
 		 512 aa  53.9  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  25.6 
 
 		 568 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  27.35 
 
 		 310 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  27.05 
 
 		 567 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  32.79 
 
 		 602 aa  52.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  25.06 
 
 		 620 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  26.3 
 
 		 530 aa  52  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  37.18 
 
 		 603 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  26.6 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  38.03 
 
 		 558 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  36.62 
 
 		 580 aa  50.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  38.03 
 
 		 584 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  34.67 
 
 		 605 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  30.08 
 
 		 714 aa  47.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  34.78 
 
 		 565 aa  47.4  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  31.86 
 
 		 198 aa  46.6  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  31.45 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  25.77 
 
 		 222 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  32.73 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  22.19 
 
 		 585 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  32.48 
 
 		 169 aa  44.3  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  31.43 
 
 		 432 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  34.74 
 
 		 581 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  34.74 
 
 		 581 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  27.4 
 
 		 441 aa  43.5  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>