More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7549 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  84.35 
 
 		 425 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  91.16 
 
 		 364 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 389 aa  796    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  89.38 
 
 		 389 aa  710    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  89.38 
 
 		 389 aa  710    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  87.43 
 
 		 385 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  86.98 
 
 		 398 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 330 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  31.89 
 
 		 330 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 356 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0082  hypothetical protein  32.09 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00626494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0132  AraC-type DNA-binding domain-containing proteins  31.25 
 
 		 337 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.968788  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0121  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 334 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0425295  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 366 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3221  transcriptional regulator, putative  30.22 
 
 		 339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 366 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  29.26 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 369 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 345 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 360 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 364 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  26.63 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  27.92 
 
 		 356 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  26.71 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 350 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  27.6 
 
 		 356 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 343 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 347 aa  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 341 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  27.55 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 340 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  29.41 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  25.55 
 
 		 341 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  30.97 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 345 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1446  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  26.07 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 343 aa  106  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  22.19 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 331 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  25.5 
 
 		 360 aa  103  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 373 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  26.71 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 343 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>