222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6181 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1256  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  99.44 
 
 
356 aa  699    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.307544  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6576  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  99.44 
 
 
356 aa  699    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807047  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6181  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 
356 aa  702    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.391334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2579  ABC transporter substrate-binding protein  61.92 
 
 
344 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.090256 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6563  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  64.52 
 
 
348 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6148  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  63.93 
 
 
348 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0762309  hitchhiker  0.00309202 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5886  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  60.12 
 
 
346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.651755 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4828  putative sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  59.18 
 
 
347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0277486  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5162  ABC transporter binding protein  64.42 
 
 
348 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2580  ABC transporter substrate-binding protein  58.18 
 
 
345 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0840198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2340  ABC transporter binding protein  58.93 
 
 
351 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0518238  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0517  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  60.44 
 
 
346 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5159  ABC transporter binding protein  60.9 
 
 
347 aa  358  7e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.535798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0404  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  43.3 
 
 
368 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1740  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.87 
 
 
372 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0845  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.81 
 
 
381 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0909  methylthioribose-binding protein  34.29 
 
 
370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0661  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  34.29 
 
 
370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0665  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.41 
 
 
370 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2370  hypothetical protein  29.94 
 
 
357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1137  hypothetical protein  28.71 
 
 
354 aa  132  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2876  hypothetical protein  30.94 
 
 
358 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3029  hypothetical protein  27.35 
 
 
358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000284319  normal  0.0136248 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2457  hypothetical protein  27.35 
 
 
358 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1193  hypothetical protein  29.11 
 
 
357 aa  126  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3048  hypothetical protein  29.34 
 
 
358 aa  125  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2556  putative sugar ABC transporter  27.07 
 
 
358 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1283  hypothetical protein  28.48 
 
 
358 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.81326  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0636  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.83 
 
 
354 aa  112  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000233808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.34 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6710  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  25.99 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.72 
 
 
317 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221092 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5809  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  25.74 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2582  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.82 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.86 
 
 
319 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.2 
 
 
321 aa  60.1  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4070  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  31.16 
 
 
328 aa  60.1  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3320  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.08 
 
 
311 aa  59.7  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0158  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  23.42 
 
 
319 aa  59.3  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000066936 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0812  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.33 
 
 
319 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0812  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.33 
 
 
319 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1824  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.28 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00471967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01070  monosaccharide-binding protein  27.24 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3770  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.43 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.741987  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3126  monosaccharide-transporting ATPase  25.09 
 
 
310 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2340  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.2 
 
 
306 aa  56.2  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.310763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0113  putative ABC-type sugar transport system  30.65 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0577  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.4 
 
 
358 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.130999  normal  0.503483 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1336  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  25.2 
 
 
312 aa  55.8  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.454554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2119  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  25.71 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0292  monosaccharide-transporting ATPase  24.16 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2971  putative sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.85 
 
 
347 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100497 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2763  sugar ABC transporter sugar-binding protein  25.85 
 
 
347 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0235197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2713  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.85 
 
 
347 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.209039  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2975  sugar ABC transporter sugar-binding protein  25.85 
 
 
347 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.582492  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1599  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.57 
 
 
301 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.72 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2693  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.85 
 
 
347 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.614777  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3422  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.66 
 
 
310 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.544688  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3533  putative periplasmic solute-binding protein  27.14 
 
 
333 aa  52.8  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3013  putative sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.42 
 
 
347 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1187  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  24.15 
 
 
337 aa  52.8  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.287912  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4654  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.47 
 
 
313 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.995284  normal  0.589042 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4189  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.52 
 
 
343 aa  52.8  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1401  ribose ABC transporter, substrate binding protein  25.56 
 
 
315 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3012  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25.42 
 
 
347 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156643  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3687  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  28.66 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.743219  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1919  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.31 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0923  monosaccharide-transporting ATPase  25.1 
 
 
289 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2266  putative sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.42 
 
 
347 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.092972 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4759  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.47 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125335  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3064  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.98 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2976  putative sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25 
 
 
347 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0830  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.83 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.84032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0343  D-ribose transporter subunit RbsB  22.18 
 
 
292 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.62 
 
 
315 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1794  monosaccharide-transporting ATPase  28.19 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7473  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.91 
 
 
319 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0461677  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2594  putative periplasmic binding ABC transporter protein  42.11 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.693301  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0973  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.04 
 
 
343 aa  50.8  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000623082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.57 
 
 
349 aa  50.4  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4011  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.52 
 
 
328 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131793  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4293  hypothetical protein  23.89 
 
 
347 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1150  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.45 
 
 
359 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1051  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  25.37 
 
 
371 aa  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.28211  normal  0.0668071 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4323  hypothetical protein  23.89 
 
 
347 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4637  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  25.86 
 
 
308 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.146123  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3058  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.88 
 
 
370 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4408  hypothetical protein  25.63 
 
 
347 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4406  hypothetical protein  25.63 
 
 
347 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4615  secreted solute binding protein  37.23 
 
 
335 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5971  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  28.57 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00726122  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1369  D-ribose transporter subunit RbsB  23.08 
 
 
292 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2666  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.87 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157111  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5972  rbsB; ABC transporter substrate binding protein (ribose)  28.31 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0701  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  24.84 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199726  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1681  putative secreted solute-binding lipoprotein  37.23 
 
 
344 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156663  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3164  Monosaccharide-transporting ATPase  23.12 
 
 
310 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2605  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.17 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0069  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.61 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>