More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3818 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  100 
 
 
250 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  95.2 
 
 
250 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  95.2 
 
 
250 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  85.48 
 
 
250 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  78.42 
 
 
253 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  76.35 
 
 
253 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  74.07 
 
 
255 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  41.32 
 
 
246 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  38.31 
 
 
246 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  42.15 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  37.18 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  37.65 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.93 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.712689  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  36.64 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.87 
 
 
232 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5594  Methyltransferase type 11  38.12 
 
 
249 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709179  normal  0.912769 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21030  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.6 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  31.8 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  34.85 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  27.49 
 
 
261 aa  93.2  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  27.49 
 
 
261 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  27.06 
 
 
262 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  27.06 
 
 
262 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  27.73 
 
 
256 aa  92  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  27.17 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  26.67 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  26.54 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  24.12 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  24.35 
 
 
251 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  25.73 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  29.56 
 
 
261 aa  72  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  27.01 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  24.31 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  42.61 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  42.61 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  29.3 
 
 
315 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  27.73 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  29.36 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  32.28 
 
 
268 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  23.64 
 
 
277 aa  63.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
244 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  28.74 
 
 
575 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  26.05 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  27.12 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  27.12 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  27.12 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  27.12 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  27.12 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  27.12 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  27.12 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  35.58 
 
 
296 aa  62  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  33.01 
 
 
266 aa  62  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  32.5 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.47 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  33.98 
 
 
281 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  31.13 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  32.5 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.91 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 
246 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  30.83 
 
 
239 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  31.67 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  31.67 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  30.83 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  28.12 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  39.25 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  31.25 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  24.06 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  26.27 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  30.77 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  30.77 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  25.11 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.09 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.78 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  38.53 
 
 
232 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  23.05 
 
 
263 aa  56.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  28.35 
 
 
269 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  24.79 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  33.86 
 
 
255 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  30.36 
 
 
231 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  24.66 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  29.52 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  29.52 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  20.1 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  31.82 
 
 
273 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  29.52 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  37.61 
 
 
255 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  29.91 
 
 
276 aa  55.8  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  37.68 
 
 
291 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>