115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2114 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  98.5 
 
 
200 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  98.5 
 
 
200 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  93.5 
 
 
200 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  89 
 
 
200 aa  351  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  90 
 
 
200 aa  338  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  86 
 
 
200 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  75.38 
 
 
205 aa  285  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  74.87 
 
 
205 aa  284  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  78.26 
 
 
205 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  78.26 
 
 
205 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  78.26 
 
 
205 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  78.26 
 
 
205 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  76.63 
 
 
205 aa  277  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  76.09 
 
 
187 aa  274  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  68.75 
 
 
205 aa  258  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  67.37 
 
 
200 aa  246  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  66.32 
 
 
199 aa  236  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  66.12 
 
 
188 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  64.48 
 
 
188 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  65.19 
 
 
190 aa  217  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  59.57 
 
 
191 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  57.89 
 
 
191 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  54.87 
 
 
209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  59.15 
 
 
190 aa  180  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  60.59 
 
 
195 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  57.93 
 
 
194 aa  176  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  55.8 
 
 
207 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  56.8 
 
 
212 aa  174  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  56.47 
 
 
194 aa  170  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  50.76 
 
 
194 aa  167  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  55.85 
 
 
189 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  52.12 
 
 
172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  51.38 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  53.67 
 
 
192 aa  162  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  49.46 
 
 
177 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  51.23 
 
 
173 aa  156  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  54.3 
 
 
195 aa  154  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  34.5 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  35.19 
 
 
183 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  41.45 
 
 
176 aa  98.6  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  36.36 
 
 
175 aa  98.6  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  45.69 
 
 
174 aa  97.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  40 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  36.36 
 
 
174 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  35.71 
 
 
174 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  38.03 
 
 
181 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  36.99 
 
 
177 aa  92.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  38.03 
 
 
181 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  38.65 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  33.54 
 
 
181 aa  84.7  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  36.43 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  38.41 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  39.87 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  37.74 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  36.48 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  34.21 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  36.88 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  37.59 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  34.59 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  34.19 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  36.6 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  39.86 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  39.86 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  32.28 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  34.1 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  32.35 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  30.83 
 
 
276 aa  62.8  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  35.85 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  29.32 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  25.17 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  31.07 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  25.35 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  25.35 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
211 aa  55.5  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  24.32 
 
 
200 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  35.76 
 
 
202 aa  54.7  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29824  predicted protein  30.63 
 
 
358 aa  53.9  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  23.78 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  31.16 
 
 
190 aa  52.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  35.36 
 
 
207 aa  52  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
212 aa  52  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  31.43 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  23.57 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
216 aa  48.9  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  30.12 
 
 
204 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1848  hypothetical protein  39.78 
 
 
205 aa  47.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  25.19 
 
 
200 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  36.42 
 
 
218 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  32.93 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  47.62 
 
 
319 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  37.09 
 
 
208 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  26.4 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2826  hypothetical protein  29.41 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.232142  normal  0.188578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  33.12 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>