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for query gene Bcen_5533 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5533  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  805    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.748731  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6406  major facilitator transporter  97.07 
 
 		 410 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.671543  normal  0.868743 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5897  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  805    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.733334 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4301  major facilitator superfamily MFS_1  70 
 
 		 396 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.555384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4411  major facilitator superfamily MFS_1  70 
 
 		 396 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3322  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  63.21 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4433  major facilitator transporter  60.93 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.944293  normal  0.4083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.64 
 
 		 465 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.9 
 
 		 424 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2456  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.46 
 
 		 418 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202004  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.18 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1536  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.94 
 
 		 408 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5152  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.82 
 
 		 413 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.94 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1144  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.93 
 
 		 395 aa  193  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1286  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.11 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000624071 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.63 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  35 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.03 
 
 		 393 aa  133  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.73 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  34.24 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.24 
 
 		 401 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.24 
 
 		 399 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  33.88 
 
 		 414 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.24 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.72 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  29.72 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.72 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.39 
 
 		 405 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.49 
 
 		 398 aa  126  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.89 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.46 
 
 		 393 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.72 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.35 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.96 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_009439  Pmen_1103  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.43 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.278959  decreased coverage  0.00752766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.21 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.93 
 
 		 399 aa  123  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.21 
 
 		 398 aa  123  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.12 
 
 		 396 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.12 
 
 		 396 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.12 
 
 		 396 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
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NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.19 
 
 		 396 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.19 
 
 		 396 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.38 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.16 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.16 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  28.16 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.84 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.16 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.16 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.89 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.16 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.89 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  29.26 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.71 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.94 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.83 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.05 
 
 		 425 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.93 
 
 		 412 aa  116  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  30.46 
 
 		 426 aa  116  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1232  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.5 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.9 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.72 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  31.41 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.88 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3306  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.21 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.82 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.8 
 
 		 461 aa  113  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.02 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.9 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.24 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.2 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.53 
 
 		 413 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3944  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.63 
 
 		 401 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.25 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1320  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.16 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.68 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.23 
 
 		 413 aa  110  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.43 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.37 
 
 		 411 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  29.31 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.29 
 
 		 438 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.53 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.97 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.63 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.92 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
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NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  29.53 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  29.05 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.32 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  28.14 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.62 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.62 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
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