231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1238 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 
431 aa  811    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  58.89 
 
 
446 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  58.01 
 
 
462 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  56.91 
 
 
451 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  56.49 
 
 
453 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  55.35 
 
 
436 aa  364  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  55.7 
 
 
463 aa  362  8e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  54.88 
 
 
434 aa  360  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  57.48 
 
 
442 aa  358  8e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  62.69 
 
 
447 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.49 
 
 
436 aa  351  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.98 
 
 
436 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  57.29 
 
 
434 aa  348  8e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  57.72 
 
 
437 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.51 
 
 
447 aa  346  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.06 
 
 
441 aa  345  7e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.06 
 
 
450 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.8 
 
 
450 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  56.05 
 
 
432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  54.4 
 
 
429 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  56.35 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.23 
 
 
464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.01 
 
 
461 aa  328  9e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.55 
 
 
449 aa  327  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  50.84 
 
 
413 aa  322  6e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  50.68 
 
 
408 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  48.69 
 
 
422 aa  302  7.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  54.88 
 
 
539 aa  302  9e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  51.75 
 
 
429 aa  300  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  47.86 
 
 
402 aa  295  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  47.97 
 
 
433 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  51.51 
 
 
390 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  50.68 
 
 
414 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  47.77 
 
 
401 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  46.93 
 
 
404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  49.43 
 
 
442 aa  264  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  50.43 
 
 
440 aa  257  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  51.8 
 
 
436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  41.65 
 
 
472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.55 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0869  putative Na+/H+ antiporter NhaA  40.74 
 
 
419 aa  240  5e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  39 
 
 
383 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.15 
 
 
394 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  42.18 
 
 
445 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  41.64 
 
 
396 aa  235  9e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.55 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.12 
 
 
382 aa  233  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  39.09 
 
 
470 aa  233  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  43.77 
 
 
391 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.78 
 
 
390 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  41.74 
 
 
425 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  38.05 
 
 
455 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.67 
 
 
397 aa  229  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  40 
 
 
391 aa  229  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.19 
 
 
391 aa  229  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  40.17 
 
 
465 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  43.52 
 
 
481 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  34.85 
 
 
395 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  38.1 
 
 
451 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  38.52 
 
 
406 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.72 
 
 
389 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  36.57 
 
 
424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  42 
 
 
391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.95 
 
 
389 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.67 
 
 
389 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.95 
 
 
389 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  37.7 
 
 
382 aa  226  7e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  38.9 
 
 
436 aa  226  8e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  43.55 
 
 
423 aa  226  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.65 
 
 
391 aa  226  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.84 
 
 
389 aa  225  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  37.99 
 
 
394 aa  224  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  37.91 
 
 
451 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  42.47 
 
 
393 aa  224  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  36.74 
 
 
464 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  37.43 
 
 
382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1876  Na+/H+ antiporter  36.99 
 
 
387 aa  223  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.85 
 
 
407 aa  223  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  39.23 
 
 
455 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.25 
 
 
401 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  35.44 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.7 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.78 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4221  NhaA family transporter: sodium ion/proton  40.74 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  38.27 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.78 
 
 
389 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.78 
 
 
389 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  37.78 
 
 
408 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  36.11 
 
 
386 aa  219  5e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  40.61 
 
 
402 aa  219  8.999999999999998e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  34.83 
 
 
438 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.43 
 
 
398 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.21 
 
 
400 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.91 
 
 
391 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.69 
 
 
393 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  38.72 
 
 
450 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.43 
 
 
397 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.14 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  42.13 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  34.42 
 
 
450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>