69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0671 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  100 
 
 
153 aa  300  4.0000000000000003e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  63.64 
 
 
154 aa  174  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  58.55 
 
 
155 aa  166  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  60.25 
 
 
324 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  56.95 
 
 
160 aa  159  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  55.41 
 
 
157 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  55.41 
 
 
157 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  55.41 
 
 
157 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 
163 aa  158  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  48.03 
 
 
153 aa  154  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  54.36 
 
 
154 aa  153  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  51.27 
 
 
162 aa  153  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  55.33 
 
 
164 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  55.13 
 
 
165 aa  149  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  55.03 
 
 
155 aa  147  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  50.98 
 
 
163 aa  147  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  50 
 
 
152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  51.01 
 
 
162 aa  144  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  52.29 
 
 
163 aa  145  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  55.86 
 
 
174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  51.53 
 
 
168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  60.67 
 
 
154 aa  144  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  54.05 
 
 
155 aa  143  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  47.97 
 
 
166 aa  140  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 
160 aa  140  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 
154 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
154 aa  136  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  53.25 
 
 
154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  50.68 
 
 
155 aa  134  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  43.24 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 
154 aa  130  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 
166 aa  128  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  52.7 
 
 
156 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
162 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  33.59 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  35.43 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  32.52 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  32.52 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  32.52 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  32.52 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  32.52 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  32.52 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  32.52 
 
 
158 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  29.33 
 
 
305 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  23.81 
 
 
141 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  23.81 
 
 
141 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
182 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
333 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  30 
 
 
229 aa  41.2  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  40 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
351 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0814  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.82 
 
 
176 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0198094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>