More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0768 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  100 
 
 		 442 aa  895    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  74.21 
 
 		 442 aa  675    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  45.06 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  62.96 
 
 		 272 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  62.96 
 
 		 272 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  57.37 
 
 		 396 aa  296  5e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  41.82 
 
 		 646 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  42.28 
 
 		 1635 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  46.77 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  40.85 
 
 		 477 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  34.8 
 
 		 373 aa  163  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  42.94 
 
 		 351 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  33.33 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  35.4 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  30.74 
 
 		 1085 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  36.31 
 
 		 995 aa  81.6  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00750  hypothetical protein  31.82 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.32 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  32.41 
 
 		 488 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3279  hypothetical protein  29.61 
 
 		 190 aa  67  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  37.62 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 255 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 226 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  27.7 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  33.1 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  33.33 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  30.84 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  31.48 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  29.03 
 
 		 231 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1457  hypothetical protein  30.25 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.25 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 		 1106 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  31.43 
 
 		 672 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 214 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 250 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 262 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  28.39 
 
 		 401 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 197 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  30.5 
 
 		 194 aa  55.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 242 aa  55.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 243 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  31.45 
 
 		 229 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 250 aa  54.3  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 256 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  39 
 
 		 706 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 237 aa  54.3  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 303 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 282 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 261 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 342 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  28.79 
 
 		 535 aa  53.9  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  32.14 
 
 		 229 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  32.14 
 
 		 229 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 210 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1253  hypothetical protein  26.71 
 
 		 255 aa  53.5  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 240 aa  53.5  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  31.07 
 
 		 323 aa  53.5  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 		 234 aa  53.1  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 265 aa  53.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 286 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 457 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1966  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 264 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4098  methionine biosynthesis MetW  31.07 
 
 		 230 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 295 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 259 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 291 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  30 
 
 		 199 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 259 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 		 236 aa  51.6  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 240 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  24.29 
 
 		 244 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  33.33 
 
 		 206 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.72 
 
 		 262 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 1177 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.71 
 
 		 238 aa  50.8  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 225 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  32.73 
 
 		 276 aa  50.4  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 1177 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4251  methionine biosynthesis MetW  31.07 
 
 		 231 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  33.94 
 
 		 262 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  30.77 
 
 		 274 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 264 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 244 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 267 aa  50.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 243 aa  50.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  27.27 
 
 		 233 aa  50.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 211 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  30.41 
 
 		 209 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  28.57 
 
 		 202 aa  50.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.415093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>