229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1384 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1384  glycosyltransferase  100 
 
 
316 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3166  glycosyl transferase, group 1 family protein  99.05 
 
 
316 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3037  glycosyl transferase, group 1 family protein  99.68 
 
 
316 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6395  glycosyl transferase group 1  83.86 
 
 
316 aa  547  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231672  normal  0.0895127 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5647  glycosyl transferase, group 1  84.18 
 
 
316 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1380  glycosyl transferase, group 1  82.59 
 
 
316 aa  540  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6449  glycosyl transferase, group 1  82.59 
 
 
316 aa  540  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6041  glycosyl transferase group 1  82.59 
 
 
316 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196578  normal  0.930555 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5445  glycosyl transferase group 1  80.38 
 
 
316 aa  524  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827346 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1008  glycosyltransferase  99.12 
 
 
233 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.371268  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1296  hypothetical protein  99.12 
 
 
233 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4382  glycosyl transferase, group 1  65.61 
 
 
315 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4887  glycosyl transferase, group 1  64.06 
 
 
330 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0758774 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3810  putative glycosyl transferase, group 1  64.06 
 
 
330 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  62.22 
 
 
318 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  60.38 
 
 
330 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3726  glycosyl transferase group 1  57.88 
 
 
465 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1782  glycosyltransferase  55.56 
 
 
329 aa  352  5e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  52.92 
 
 
333 aa  342  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5046  glycosyltransferase  48.55 
 
 
347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0121544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  45.05 
 
 
314 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  44.59 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0714  glycosyl transferase, group 1  41.27 
 
 
315 aa  211  9e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0520685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2456  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
319 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652832  normal  0.243441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0458  transferase  39.57 
 
 
326 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.425335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2646  group 1 glycosyl transferase  40.94 
 
 
319 aa  185  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11340  glycosyltransferase  38.41 
 
 
314 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.852115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0354  transferase  38.36 
 
 
338 aa  179  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0568  transferase  36.16 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1572  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 
350 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999019  normal  0.0163981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1761  hypothetical protein  36.99 
 
 
325 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1747  hypothetical protein  37.3 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1007  glycosyltransferase  100 
 
 
81 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.839313  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1295  putative transferase  100 
 
 
81 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222495  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
385 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  32.28 
 
 
431 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
358 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  33.33 
 
 
409 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
346 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  33.07 
 
 
392 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2321  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
408 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 
367 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
689 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
386 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
381 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2417  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
373 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
395 aa  52.8  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  32.54 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  30.23 
 
 
397 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
394 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
435 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1807  glycosyl transferase, group 1  36.54 
 
 
456 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5208  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 
425 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  normal  0.673241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  28.93 
 
 
382 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
458 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  30.58 
 
 
386 aa  50.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  29.06 
 
 
404 aa  49.7  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
384 aa  49.7  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
367 aa  49.7  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
420 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  22.61 
 
 
375 aa  49.3  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
440 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  29.66 
 
 
404 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
390 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3907  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
370 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
384 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2479  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
408 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.48 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 
370 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2850  hypothetical protein  26.92 
 
 
311 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
414 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  25.62 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
414 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2121  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
372 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.430294  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  33.33 
 
 
385 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  30.77 
 
 
416 aa  47.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 
398 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
355 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  27.91 
 
 
401 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
375 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
743 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 
367 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 
386 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  38.38 
 
 
374 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
418 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
414 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  33.64 
 
 
411 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  33.72 
 
 
392 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4583  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
416 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
417 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0054  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
305 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510495  normal  0.478799 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
457 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
393 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3898  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
433 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
383 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  30.77 
 
 
360 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>