More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0421 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0421  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
411 aa  835    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0822776  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0364  glycosyl transferase, group 1 family protein  99.51 
 
 
412 aa  832    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3374  glycosyl transferase group 1  75.86 
 
 
408 aa  644    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0766435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3341  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 
426 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178171  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5787  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2150  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
437 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  26.37 
 
 
420 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6301  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
428 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4917  group 1 glycosyl transferase  26.22 
 
 
422 aa  104  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0868  a-glycosyltransferase  26.38 
 
 
402 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0630159 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2761  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
419 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
407 aa  104  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2879  glycosyl transferase group 1  37.39 
 
 
385 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.658622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2971  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
391 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.176769  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05800  glycosyltransferase  37.39 
 
 
437 aa  100  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.504823  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1818  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
382 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1006  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
382 aa  89  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
372 aa  87  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1382  glycosyltransferase-like protein  28.25 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.702037  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.93 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.93 
 
 
406 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.93 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.93 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.79 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  31.8 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  31.8 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  33.18 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
810 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
406 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  34.04 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  33.51 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  33.7 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6549  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6548  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
803 aa  70.5  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0058  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  25.49 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
452 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  35.15 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
419 aa  67  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
378 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.11 
 
 
396 aa  67  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
440 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
440 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.91 
 
 
409 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  42.55 
 
 
371 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
404 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  41.11 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
382 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
539 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.93 
 
 
401 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  32.41 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  27.75 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 
426 aa  64.7  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0054  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510495  normal  0.478799 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
346 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 
381 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
362 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  27 
 
 
430 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
417 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
372 aa  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
381 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.48 
 
 
407 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
412 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
459 aa  63.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
391 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
364 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>