More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3147 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  100 
 
 		 372 aa  763    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  100 
 
 		 519 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  57.22 
 
 		 384 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  52.96 
 
 		 370 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  41.32 
 
 		 373 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  40.82 
 
 		 361 aa  258  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  42.62 
 
 		 361 aa  245  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  42.62 
 
 		 361 aa  245  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  42.62 
 
 		 361 aa  245  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  42.62 
 
 		 361 aa  245  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  42.62 
 
 		 361 aa  245  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  42.62 
 
 		 361 aa  245  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  42.62 
 
 		 361 aa  245  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  37.5 
 
 		 395 aa  233  6e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  34.63 
 
 		 367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  33.61 
 
 		 364 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  33.61 
 
 		 364 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  34.88 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  38.34 
 
 		 312 aa  195  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  35.02 
 
 		 323 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5398  phage integrase family protein  28 
 
 		 399 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5418  phage integrase family protein  28 
 
 		 399 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0512  phage integrase family protein  28 
 
 		 399 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  28.38 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3803  phage integrase family protein  27 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704516  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3970  phage integrase family protein  27 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1934  phage integrase  27 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3698  integrase family protein  27.05 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0843425  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3740  integrase family protein  27.05 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3469  integrase family protein  27.05 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00208728  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1215  integrase family protein  27.05 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0266422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3585  integrase family protein  27.05 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0961554  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3603  integrase family protein  27.05 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185249  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3044  integrase family protein  27.05 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169579  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  25.33 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0478  phage integrase family protein  25.7 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5935  phage integrase family protein  25.7 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3904  phage integrase family protein  25.7 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3896  phage integrase family protein  25.7 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2972  phage integrase family protein  23.25 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2265  phage integrase family protein  23.25 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4792  phage integrase family protein  23.25 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2147  phage integrase  22.84 
 
 		 411 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3532  phage integrase  22.84 
 
 		 411 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.346968  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  29.13 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  29.85 
 
 		 295 aa  88.6  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  23.71 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  25.44 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  25.44 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  25.44 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.6 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.6 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  22.61 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.3 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.3 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  22.61 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.3 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  22.61 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.3 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.3 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.3 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.3 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  30.68 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  26.13 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  24.01 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  24.39 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3442  phage integrase  26.64 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  30.36 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2053  phage integrase-like SAM-like  32.35 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227287  normal  0.287411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.3 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  25.56 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.83 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.64 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  24.48 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  23.12 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  22.94 
 
 		 283 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  27.83 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.78 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  24.64 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  30.49 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.78 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  29.28 
 
 		 307 aa  72  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  29.95 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.8 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3609  site-specific recombinase, phage integrase family  26.43 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  23.94 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  28.92 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  28.8 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  29.07 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1455  integrase family protein  29.07 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.25 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.25 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.25 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.61 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.25 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.25 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>