More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0166 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  69.86 
 
 		 233 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  72.86 
 
 		 234 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  71.43 
 
 		 237 aa  314  7e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  74.37 
 
 		 260 aa  307  6.999999999999999e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  71.83 
 
 		 277 aa  304  8.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  69.12 
 
 		 223 aa  297  9e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  50.74 
 
 		 211 aa  191  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  50 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  49.28 
 
 		 212 aa  187  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  50.77 
 
 		 211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  49.74 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  49.74 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  48.47 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  45.54 
 
 		 226 aa  173  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  49.45 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  46.97 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  46.43 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  52.5 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  47 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  46.67 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  50.29 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  44.16 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  44.16 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  44.16 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  42.79 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  45.45 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  40.61 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  39.29 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  36.6 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  42.63 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  42.93 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  39.59 
 
 		 193 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  43.41 
 
 		 195 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  36.92 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  35.78 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  35.29 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  34.36 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  38.18 
 
 		 236 aa  92.8  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  41.79 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  33.8 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  33.5 
 
 		 217 aa  88.6  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  33.95 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  37.01 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  33.51 
 
 		 245 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  38.06 
 
 		 223 aa  85.5  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  34.55 
 
 		 239 aa  85.1  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  36.25 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  32.56 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  35.93 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  34.38 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  36.31 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  35.98 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  36.94 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  32.32 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  31.98 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  33.13 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  30.3 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0042  methyltransferase GidB  36.46 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  36.6 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  34.9 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  32.08 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  32.26 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  28.48 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  34.38 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  32.39 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  31.45 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  31.15 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  32.91 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  31.45 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  29.52 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  30.27 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  31.22 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  34.57 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  32.08 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  31.58 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  30.46 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  34.91 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  35.45 
 
 		 241 aa  74.7  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  30.91 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  40 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  30.25 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  32.12 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  30.86 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  29.57 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  32.12 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  37.66 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  32.8 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  30.63 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  32.1 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  27.65 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1812  glucose inhibited division protein  31.67 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  29.32 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4081  methyltransferase GidB  29.89 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.342652  normal  0.185118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  31.01 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  30.3 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  34.78 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  31.9 
 
 		 238 aa  72  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  36.18 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>