More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3577 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  100 
 
 
718 aa  1464  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  36.8 
 
 
699 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  37.55 
 
 
863 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  39.36 
 
 
719 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  36.8 
 
 
829 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  38.14 
 
 
771 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  37.15 
 
 
797 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3417  TonB dependent outer membrane ferrichrome-iron receptor  36 
 
 
715 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  37.55 
 
 
771 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  36.55 
 
 
723 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3330  hypothetical protein  37.03 
 
 
714 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.641382  normal  0.572781 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3062  TonB-dependent siderophore receptor  36 
 
 
715 aa  402  1e-110  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.173013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  35.54 
 
 
733 aa  400  1e-110  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 
817 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.69 
 
 
806 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  35.46 
 
 
708 aa  395  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 
819 aa  392  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  37.45 
 
 
797 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  1.23032e-08 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  37.3 
 
 
821 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  36.85 
 
 
729 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  37.39 
 
 
797 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 
778 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  36.71 
 
 
829 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.12 
 
 
833 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  35.32 
 
 
729 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  36.01 
 
 
740 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 
745 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  35.6 
 
 
724 aa  385  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  35.94 
 
 
745 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  37.09 
 
 
799 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  36.77 
 
 
797 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  38.42 
 
 
812 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  36.06 
 
 
815 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 
779 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  36.41 
 
 
726 aa  379  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  34.42 
 
 
808 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  36.31 
 
 
769 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  35.22 
 
 
806 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  35.06 
 
 
799 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3474  ferrichrome receptor precursor protein  34.65 
 
 
719 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588367  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  35.56 
 
 
791 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  35.41 
 
 
791 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3585  ferrichrome receptor precursor protein  36.61 
 
 
718 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.885271  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  35.94 
 
 
724 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  35.78 
 
 
822 aa  361  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  35.13 
 
 
729 aa  362  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  34.52 
 
 
727 aa  361  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  33.95 
 
 
747 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  34.99 
 
 
729 aa  359  8e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 
750 aa  358  3e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  34.5 
 
 
797 aa  357  4e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  34.78 
 
 
729 aa  357  4e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 
717 aa  357  5e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  3.6194e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  33.82 
 
 
747 aa  356  6e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  35.38 
 
 
801 aa  356  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 
810 aa  354  3e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  35.54 
 
 
744 aa  354  3e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  35.2 
 
 
703 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  35.2 
 
 
703 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  35.04 
 
 
754 aa  353  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  33.95 
 
 
745 aa  353  8e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  35.54 
 
 
744 aa  351  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  34.12 
 
 
747 aa  349  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  33.99 
 
 
747 aa  348  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  33.99 
 
 
747 aa  347  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  34.42 
 
 
784 aa  347  5e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  34.44 
 
 
714 aa  345  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  34.1 
 
 
733 aa  344  3e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 
753 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  34.11 
 
 
752 aa  342  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  33.42 
 
 
740 aa  342  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 
743 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  32.76 
 
 
747 aa  341  3e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  34.82 
 
 
828 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 
802 aa  339  1e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  33.23 
 
 
750 aa  338  2e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 
810 aa  338  2e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  35.63 
 
 
719 aa  336  9e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
747 aa  336  9e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  33.86 
 
 
747 aa  335  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  33.86 
 
 
747 aa  335  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  35.73 
 
 
789 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 
726 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 
737 aa  333  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 
810 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  34.54 
 
 
699 aa  333  7e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 
757 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  32.84 
 
 
728 aa  332  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 
810 aa  329  1e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  34.49 
 
 
717 aa  329  1e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  34.82 
 
 
799 aa  329  1e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 
717 aa  329  1e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 
728 aa  327  4e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 
745 aa  327  5e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 
820 aa  327  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  2.2757e-05 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  32.68 
 
 
735 aa  325  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 
734 aa  325  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 
738 aa  325  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 
831 aa  324  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  30.14 
 
 
740 aa  323  8e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>