More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0316 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  100 
 
 		 330 aa  678    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  80.3 
 
 		 330 aa  557  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  79.39 
 
 		 330 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  76.06 
 
 		 330 aa  534  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  68.18 
 
 		 330 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  68.18 
 
 		 330 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  66.67 
 
 		 330 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  67.37 
 
 		 331 aa  457  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  56.23 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  55.14 
 
 		 328 aa  355  5e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  51.07 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  52.91 
 
 		 333 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  53.89 
 
 		 337 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  52.91 
 
 		 333 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  51.38 
 
 		 335 aa  342  5e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  52.15 
 
 		 329 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  52.91 
 
 		 333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  51.68 
 
 		 333 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  49.85 
 
 		 337 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  49.85 
 
 		 337 aa  333  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  50.15 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  52.29 
 
 		 333 aa  328  6e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  51.55 
 
 		 333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  49.23 
 
 		 342 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  50.15 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  49.25 
 
 		 337 aa  324  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  49.24 
 
 		 331 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  51.98 
 
 		 338 aa  319  5e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  50 
 
 		 338 aa  318  7e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  49.39 
 
 		 407 aa  317  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  48.29 
 
 		 338 aa  312  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  47.96 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  46.54 
 
 		 348 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  47.37 
 
 		 332 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  48.61 
 
 		 331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  46.93 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  48.57 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  44.09 
 
 		 335 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  44.41 
 
 		 335 aa  292  5e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  49.85 
 
 		 330 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  49.54 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  48.49 
 
 		 330 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  45.35 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  42.17 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  38.75 
 
 		 333 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  43.73 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  38.44 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  37.89 
 
 		 338 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  38.05 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  40.95 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  40.13 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  38.02 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  36.56 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  34.29 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  34.29 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  33.75 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  36.14 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  31.66 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  33.03 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  31.96 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  32.42 
 
 		 339 aa  163  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  31.89 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  32.83 
 
 		 360 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  34.39 
 
 		 328 aa  159  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  29.56 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  33.21 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  29.01 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  33.04 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  26.33 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  29.55 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  28.47 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.41 
 
 		 315 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.41 
 
 		 315 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.34 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  27.9 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  27.1 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  27.1 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.41 
 
 		 315 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  27.1 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  27.1 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  25.4 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  29.43 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  28.14 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  26.67 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.56 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  24.36 
 
 		 317 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.74 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  29.96 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  27.04 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  26.41 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.71 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  28.45 
 
 		 352 aa  85.9  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  26.65 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  25.63 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  24.68 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  26.72 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  25.76 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  28.41 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  27.86 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  26.21 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>