More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0190 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  75.33 
 
 		 468 aa  678    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  71.05 
 
 		 461 aa  677    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  73.09 
 
 		 467 aa  690    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  100 
 
 		 459 aa  922    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  74.44 
 
 		 461 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  67.94 
 
 		 457 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  70.64 
 
 		 468 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  70.89 
 
 		 469 aa  680    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  71.33 
 
 		 464 aa  671    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  71.05 
 
 		 461 aa  677    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  70.77 
 
 		 461 aa  680    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  66 
 
 		 477 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  68.31 
 
 		 457 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  68.31 
 
 		 457 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  68.31 
 
 		 457 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  62.91 
 
 		 477 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  64.43 
 
 		 477 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  66.91 
 
 		 406 aa  558  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  61.06 
 
 		 463 aa  548  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  50.82 
 
 		 456 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  48.04 
 
 		 493 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  45.94 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  44.55 
 
 		 444 aa  348  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 		 439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 439 aa  331  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 468 aa  328  9e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 458 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  39.54 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 446 aa  282  8.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  37.72 
 
 		 447 aa  276  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  37.7 
 
 		 482 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 		 440 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.61 
 
 		 437 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 442 aa  259  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  36.94 
 
 		 443 aa  259  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 441 aa  256  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  36.14 
 
 		 468 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  35.45 
 
 		 430 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 		 465 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.83 
 
 		 447 aa  250  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 454 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 447 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 461 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 450 aa  244  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  39.72 
 
 		 438 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 439 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  36.24 
 
 		 447 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 439 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 435 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  35.7 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 435 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 435 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  35.78 
 
 		 456 aa  242  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  40.16 
 
 		 460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  34.2 
 
 		 434 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  34.2 
 
 		 435 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  33.94 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  32.54 
 
 		 470 aa  239  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  33.94 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  32.97 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4107  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  34.02 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  35.76 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  36.46 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  34.02 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  34.08 
 
 		 484 aa  237  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  33.68 
 
 		 435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  34.75 
 
 		 461 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  34.75 
 
 		 461 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  34.75 
 
 		 461 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 433 aa  236  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  33.96 
 
 		 467 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.45 
 
 		 437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  35.78 
 
 		 452 aa  235  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 628 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  34.78 
 
 		 435 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  38.77 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.57 
 
 		 437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  35.19 
 
 		 455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  33.65 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  36.05 
 
 		 456 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  44.16 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  35.51 
 
 		 433 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  37.05 
 
 		 437 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 		 437 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  34.14 
 
 		 466 aa  232  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  33.65 
 
 		 433 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1044  major facilitator superfamily MFS_1  36.18 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>