More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0076 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  70.82 
 
 		 636 aa  921    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  74.61 
 
 		 640 aa  962    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  74.8 
 
 		 646 aa  967    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  51.93 
 
 		 625 aa  640    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  52.52 
 
 		 642 aa  642    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  53.27 
 
 		 634 aa  664    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  52.23 
 
 		 656 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  51.9 
 
 		 643 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  52.89 
 
 		 647 aa  660    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  100 
 
 		 634 aa  1303    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  80.06 
 
 		 633 aa  1064    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  52.21 
 
 		 636 aa  653    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  51.91 
 
 		 654 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  56.33 
 
 		 644 aa  719    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  52.87 
 
 		 634 aa  660    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  71.52 
 
 		 635 aa  906    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  55.34 
 
 		 655 aa  677    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  55.36 
 
 		 644 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  56.94 
 
 		 642 aa  717    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  49.14 
 
 		 652 aa  623  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  50.39 
 
 		 647 aa  606  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  47.96 
 
 		 645 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  46.87 
 
 		 645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  46.3 
 
 		 670 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  47.1 
 
 		 681 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  47.1 
 
 		 680 aa  571  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  48.6 
 
 		 646 aa  560  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  48.44 
 
 		 666 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  48.36 
 
 		 650 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  48.89 
 
 		 651 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  49.21 
 
 		 651 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  48.73 
 
 		 651 aa  555  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  48.58 
 
 		 652 aa  551  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  48.89 
 
 		 651 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  48.89 
 
 		 651 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  47.3 
 
 		 674 aa  549  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  48.58 
 
 		 666 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  48.58 
 
 		 666 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  48.58 
 
 		 666 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  48.58 
 
 		 666 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  49.21 
 
 		 651 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  44.87 
 
 		 645 aa  545  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  48.58 
 
 		 666 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  48.58 
 
 		 666 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  48.58 
 
 		 666 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  45.96 
 
 		 659 aa  534  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  38.58 
 
 		 630 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  45.71 
 
 		 628 aa  305  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  45.14 
 
 		 628 aa  301  3e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  35.61 
 
 		 335 aa  210  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  38.04 
 
 		 337 aa  209  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  37.04 
 
 		 327 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  30.27 
 
 		 332 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  30.27 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  30.27 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  30.27 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  30.15 
 
 		 332 aa  160  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  35.17 
 
 		 336 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  36.14 
 
 		 322 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  36.09 
 
 		 312 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  30.06 
 
 		 338 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  33.74 
 
 		 317 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  33.75 
 
 		 321 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  33.85 
 
 		 320 aa  146  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  30.95 
 
 		 333 aa  146  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  30.61 
 
 		 317 aa  145  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  33.91 
 
 		 349 aa  145  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  30.56 
 
 		 326 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  34.27 
 
 		 323 aa  144  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  34.26 
 
 		 320 aa  143  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 322 aa  143  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  30.67 
 
 		 364 aa  140  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  28.53 
 
 		 338 aa  140  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  31.99 
 
 		 314 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  32.22 
 
 		 338 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  34.88 
 
 		 321 aa  137  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  30.49 
 
 		 324 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  28.19 
 
 		 322 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  31.58 
 
 		 314 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  33.03 
 
 		 325 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.29 
 
 		 329 aa  126  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  24.85 
 
 		 323 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  30.4 
 
 		 326 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  30.98 
 
 		 340 aa  118  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  28.75 
 
 		 317 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  28.22 
 
 		 345 aa  115  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  24.64 
 
 		 322 aa  115  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  24.17 
 
 		 314 aa  114  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  29.13 
 
 		 337 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  27.54 
 
 		 323 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25 
 
 		 323 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  30.15 
 
 		 314 aa  110  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  30.49 
 
 		 327 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  29.19 
 
 		 320 aa  110  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  28.27 
 
 		 320 aa  109  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  28.66 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  24.17 
 
 		 321 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  32.72 
 
 		 323 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  28.13 
 
 		 313 aa  107  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  29.18 
 
 		 327 aa  107  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>