More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3634 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  100 
 
 		 460 aa  943    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  76.92 
 
 		 455 aa  740    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  66.15 
 
 		 460 aa  618  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  64.43 
 
 		 457 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  56.73 
 
 		 485 aa  580  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  58.99 
 
 		 461 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  58.99 
 
 		 461 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  56.12 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  39.11 
 
 		 458 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  39.11 
 
 		 458 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  39.11 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  38.98 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  39.11 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  38.89 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  39.11 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  38.89 
 
 		 454 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  38.67 
 
 		 458 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  38.39 
 
 		 460 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  38.67 
 
 		 454 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  42.19 
 
 		 465 aa  350  3e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  36.7 
 
 		 468 aa  347  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1134  23S rRNA methyltransferase/RumA  40.81 
 
 		 469 aa  341  1e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  40.18 
 
 		 453 aa  339  5.9999999999999996e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  38.08 
 
 		 460 aa  333  4e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  39.73 
 
 		 465 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  39.42 
 
 		 457 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  38.93 
 
 		 453 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  37.83 
 
 		 459 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  38.27 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  35.84 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  38.44 
 
 		 457 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  37.67 
 
 		 454 aa  296  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.15 
 
 		 459 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  34.45 
 
 		 458 aa  293  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  33.71 
 
 		 459 aa  292  8e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  39.39 
 
 		 465 aa  292  8e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.93 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  34.15 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  33.78 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  33.93 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  33.93 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.93 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  33.78 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  33.78 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  35.43 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  34.1 
 
 		 455 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  34.38 
 
 		 453 aa  283  7.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  32.35 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  32.35 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  31.93 
 
 		 456 aa  280  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.1 
 
 		 455 aa  279  9e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  35.28 
 
 		 466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  33.76 
 
 		 468 aa  272  9e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  33.85 
 
 		 451 aa  272  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  36.14 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  33.77 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  34.76 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  36.03 
 
 		 468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.13 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  33.26 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  36.33 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.67 
 
 		 496 aa  261  2e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  33.26 
 
 		 471 aa  260  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  33.72 
 
 		 439 aa  259  6e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  36.42 
 
 		 436 aa  257  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  34.98 
 
 		 458 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  33.96 
 
 		 479 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31 
 
 		 513 aa  254  3e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  33.04 
 
 		 493 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  32.29 
 
 		 454 aa  250  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  30.96 
 
 		 464 aa  246  8e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  31.85 
 
 		 481 aa  245  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  35.78 
 
 		 495 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  33.11 
 
 		 489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  35.57 
 
 		 456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  31.32 
 
 		 479 aa  242  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  29.89 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  31.72 
 
 		 572 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  32 
 
 		 478 aa  239  5.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  31.4 
 
 		 447 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0615  RNA methyltransferase  35.38 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13964  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.11 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  30.91 
 
 		 470 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.47 
 
 		 462 aa  236  8e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  33.11 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  30 
 
 		 470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  32.25 
 
 		 465 aa  233  6e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  30.55 
 
 		 470 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  33.11 
 
 		 397 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.35 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  30.26 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  32.17 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  30.92 
 
 		 488 aa  230  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  30.42 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  30.95 
 
 		 488 aa  227  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  30.22 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  32.13 
 
 		 476 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  30.64 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  30 
 
 		 480 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  33.03 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>