More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2440 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  447  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.03 
 
 		 228 aa  347  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.91 
 
 		 220 aa  291  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  64.55 
 
 		 221 aa  283  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  57.73 
 
 		 219 aa  265  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2593  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.27 
 
 		 223 aa  265  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3524  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.27 
 
 		 223 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5704  two component transcriptional regulator  61.64 
 
 		 220 aa  260  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.27 
 
 		 219 aa  259  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3167  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.45 
 
 		 218 aa  258  6e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.436774  normal  0.0676898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  56.11 
 
 		 220 aa  255  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family  60 
 
 		 220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  54.95 
 
 		 222 aa  245  3e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  0.0000630157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2006  response regulator receiver  58.74 
 
 		 223 aa  245  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.379718  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2389  two component transcriptional regulator  54.09 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3998  two component transcriptional regulator  53.18 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278973  normal  0.137181 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02960  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.02 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.46 
 
 		 221 aa  225  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4900  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.66 
 
 		 221 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4935  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.34 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2344  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.21 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2869  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.73 
 
 		 232 aa  211  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 224 aa  204  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 227 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 227 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2685  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.91 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  46.19 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  43.95 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 229 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  43.24 
 
 		 226 aa  189  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.83 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 224 aa  187  9e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  46.3 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 222 aa  185  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.43 
 
 		 242 aa  184  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 227 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  44.91 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.38 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  41.7 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2743  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.38 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  42.79 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 245 aa  181  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  44.91 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  41.82 
 
 		 224 aa  181  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  42.67 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.18 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.18 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  41.44 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.18 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  41.41 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.79 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.07 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  44.44 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>