More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3731 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3731  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
411 aa  822    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3453  GAF sensor signal transduction histidine kinase  60.49 
 
 
412 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0155  GAF sensor signal transduction histidine kinase  53.44 
 
 
404 aa  359  6e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
437 aa  189  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  29.4 
 
 
542 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
399 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  25 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
620 aa  140  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
951 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  35.13 
 
 
812 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
770 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  37.83 
 
 
821 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  37.83 
 
 
821 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  37.83 
 
 
723 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  37.83 
 
 
821 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  37.83 
 
 
723 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  37.83 
 
 
723 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  37.83 
 
 
723 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
502 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  35.71 
 
 
776 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0668  histidine kinase  31.92 
 
 
700 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0742794 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
729 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
710 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2606  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
664 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
775 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
779 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
758 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
775 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
681 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
1195 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  36.25 
 
 
268 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
628 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
361 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1994  histidine kinase  31.22 
 
 
387 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376445  hitchhiker  0.00440814 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
817 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
767 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
792 aa  123  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
640 aa  122  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1296  histidine kinase  35.29 
 
 
378 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.572141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2531  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
880 aa  122  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  36.11 
 
 
733 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
1252 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
810 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2336  PAS sensor protein  32.9 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  0.135011 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
883 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
758 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
789 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
380 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  25.38 
 
 
401 aa  121  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0830  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00410023  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
521 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  31.85 
 
 
505 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.93 
 
 
662 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1145  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.49 
 
 
532 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
677 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2176  histidine kinase  33.07 
 
 
520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.955283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
869 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
1532 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  33.2 
 
 
762 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4331  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.55 
 
 
921 aa  116  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.0586924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3435  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
605 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.188279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
799 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  30 
 
 
503 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  34.73 
 
 
494 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
821 aa  116  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
626 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
515 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
960 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.02 
 
 
653 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
793 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1264  histidine kinase  34.98 
 
 
421 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
769 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  32.81 
 
 
496 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2551  ATP-binding region ATPase domain protein  27.07 
 
 
398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08056  hypothetical protein  24.38 
 
 
407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  35.47 
 
 
552 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
1064 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  34.12 
 
 
499 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
1140 aa  113  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
738 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
642 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
786 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
566 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08061  hypothetical protein  24.16 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
810 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
761 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
532 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  33.47 
 
 
616 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
1359 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.52 
 
 
549 aa  111  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
763 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  0.714834 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
973 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
721 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146546  normal  0.0234435 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 
639 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2007  putative PAS/PAC sensor protein  36.67 
 
 
692 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259838  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
1060 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>