299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2139 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  70.21 
 
 
474 aa  646    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  66.39 
 
 
482 aa  671    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  94 
 
 
483 aa  947    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  100 
 
 
483 aa  997    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  65.06 
 
 
463 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  66.11 
 
 
495 aa  626  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  63.64 
 
 
507 aa  624  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  62.6 
 
 
570 aa  611  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  68.39 
 
 
492 aa  609  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.03 
 
 
485 aa  605  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  66.32 
 
 
503 aa  606  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  68.83 
 
 
500 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  59.56 
 
 
529 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  46.9 
 
 
454 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  53.06 
 
 
447 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  50.12 
 
 
437 aa  363  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  44.98 
 
 
527 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  42.13 
 
 
433 aa  280  4e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  41.4 
 
 
509 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  44.17 
 
 
539 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  38.49 
 
 
650 aa  264  3e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  43.53 
 
 
538 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  43.64 
 
 
535 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  43.39 
 
 
539 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
239 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  39.18 
 
 
254 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
254 aa  54.7  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  29.45 
 
 
306 aa  53.5  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.8 
 
 
251 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
240 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
265 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 
255 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
233 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 
264 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
238 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
292 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
268 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152096  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.9 
 
 
288 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
255 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
257 aa  50.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
250 aa  50.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.11 
 
 
246 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  39.13 
 
 
255 aa  50.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 
256 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 
286 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
253 aa  50.4  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 
255 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
246 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
287 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
308 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2394  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
268 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.097477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  31.43 
 
 
318 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
246 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
278 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19413  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2190  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 
258 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
256 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
324 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 
284 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
328 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
314 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 
257 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
292 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3166  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
266 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0939  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 
254 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 
254 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
326 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 
286 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
360 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0340631  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
246 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
241 aa  48.5  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.19 
 
 
227 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 
250 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
255 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
261 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
255 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5615  2,3-dihydroxy-2,3-dihydrophenylpropionate dehydrogenase  33.05 
 
 
283 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.441915  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  37.23 
 
 
261 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  34.21 
 
 
251 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
284 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163262  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 
266 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1462  short chain dehydrogenase  37.37 
 
 
259 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780505  normal  0.472933 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  34.86 
 
 
254 aa  47.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
292 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
291 aa  48.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 
312 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
246 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  36.73 
 
 
254 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0621  2,3-dihydroxy-2,3-dihydrophenylpropionate dehydrogenase  33.05 
 
 
301 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.49 
 
 
275 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 
246 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509467  normal  0.742025 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
254 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0539  2,3-dihydroxy-2,3-dihydrophenylpropionate dehydrogenase  33.05 
 
 
301 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132411  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1685  2,3-dihydroxy-2,3-dihydrophenylpropionate dehydrogenase  33.05 
 
 
301 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
295 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
249 aa  47.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.012898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
292 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.082877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1714  2,3-dihydroxy-2,3-dihydrophenylpropionate dehydrogenase  33.05 
 
 
301 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1658  2,3-dihydroxy-2,3-dihydrophenylpropionate dehydrogenase  33.05 
 
 
301 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
300 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>