More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1232 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3553  glycosyl transferase family 2  70.92 
 
 
456 aa  665    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1232  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
481 aa  965    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0166  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  38.45 
 
 
513 aa  282  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5398  glycosyl transferase family 2  38.64 
 
 
507 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298595  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
509 aa  89.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.45 
 
 
1099 aa  87.4  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  31.54 
 
 
461 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  31.54 
 
 
1154 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  27.58 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
1002 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  28.9 
 
 
1118 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  26.17 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 
379 aa  77  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
1120 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.94 
 
 
1115 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  22.19 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 
1101 aa  73.9  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.24 
 
 
927 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  27.24 
 
 
1115 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  27.24 
 
 
1119 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.24 
 
 
1115 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  26.83 
 
 
872 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  35.23 
 
 
243 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  23.65 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  23.65 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 
752 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  28.9 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 
1124 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.13 
 
 
1115 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3648  hypothetical protein  27.67 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  23.22 
 
 
591 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
502 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 
789 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 
789 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 
789 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4945  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
651 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420909  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4562  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
651 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.829181  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  25 
 
 
442 aa  66.6  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4650  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
651 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.492865  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  27.03 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
483 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  27.03 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  27.03 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  26.23 
 
 
418 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  25.71 
 
 
501 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0593  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 
268 aa  64.7  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  28.51 
 
 
441 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
441 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  28.51 
 
 
412 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  28.51 
 
 
412 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  28.51 
 
 
441 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  28.51 
 
 
441 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  28.51 
 
 
441 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
475 aa  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  22.45 
 
 
443 aa  63.9  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.15 
 
 
466 aa  63.5  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  24.7 
 
 
403 aa  63.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
228 aa  63.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  42.7 
 
 
236 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  22.63 
 
 
694 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  23.26 
 
 
741 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
344 aa  62.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  25.47 
 
 
658 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 
632 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  25.33 
 
 
417 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.77 
 
 
466 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 
403 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  26.05 
 
 
421 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  23.97 
 
 
464 aa  61.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  21.34 
 
 
712 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  26.05 
 
 
421 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  40.62 
 
 
230 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2905  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
395 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  26.05 
 
 
421 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5187  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.58 
 
 
392 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575662 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 
435 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.06 
 
 
395 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2574  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.2 
 
 
503 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  28.4 
 
 
442 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
229 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  42.7 
 
 
222 aa  59.3  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
476 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
637 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  39.08 
 
 
209 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2796  glycosyl transferase family 2  24.57 
 
 
445 aa  57.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473291 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  23.63 
 
 
1184 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  25.3 
 
 
845 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  26.89 
 
 
633 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.53 
 
 
845 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  41.11 
 
 
393 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
509 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
232 aa  57.4  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
523 aa  57  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>