179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0715 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  100 
 
 
524 aa  1065    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  70.47 
 
 
521 aa  744    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  49.5 
 
 
508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  47.41 
 
 
541 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  47.2 
 
 
523 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  44.56 
 
 
542 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  44.05 
 
 
515 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  42.35 
 
 
518 aa  389  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  44.42 
 
 
521 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  42.36 
 
 
506 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  42.03 
 
 
525 aa  365  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  41.35 
 
 
527 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  40.56 
 
 
537 aa  355  8.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  39.92 
 
 
515 aa  340  4e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  40.62 
 
 
507 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  42.64 
 
 
485 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  39.09 
 
 
500 aa  332  9e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  39.75 
 
 
522 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  38.3 
 
 
533 aa  306  7e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  38.3 
 
 
508 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  38.3 
 
 
508 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  37.91 
 
 
521 aa  305  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  39.58 
 
 
495 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  34.99 
 
 
545 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  38.12 
 
 
495 aa  296  8e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  38.53 
 
 
516 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  38.17 
 
 
511 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  38.17 
 
 
511 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  38.17 
 
 
511 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  37.95 
 
 
520 aa  287  4e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  38.03 
 
 
520 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  38.44 
 
 
522 aa  282  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  36.1 
 
 
542 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  36.04 
 
 
525 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  35.2 
 
 
546 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 
505 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  36.48 
 
 
518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  37.44 
 
 
540 aa  272  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  36.02 
 
 
505 aa  266  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  34.75 
 
 
538 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  34.13 
 
 
564 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  31.75 
 
 
504 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  33.69 
 
 
505 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  33.33 
 
 
499 aa  223  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  34.53 
 
 
551 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  33.39 
 
 
557 aa  220  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  34.16 
 
 
535 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  32.56 
 
 
504 aa  216  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  31.34 
 
 
476 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  34.45 
 
 
551 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  31.86 
 
 
535 aa  207  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  31.54 
 
 
506 aa  206  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  30.72 
 
 
544 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  31.94 
 
 
515 aa  204  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  31.08 
 
 
542 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  30.97 
 
 
478 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  32.4 
 
 
484 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  31.43 
 
 
571 aa  193  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  31.51 
 
 
643 aa  192  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  32.33 
 
 
532 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  28.33 
 
 
486 aa  187  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  28.98 
 
 
530 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  31.46 
 
 
518 aa  176  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  29.83 
 
 
508 aa  176  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  30.95 
 
 
555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  31.8 
 
 
546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  28.41 
 
 
556 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  30.98 
 
 
505 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  29.53 
 
 
520 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  29.93 
 
 
504 aa  167  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  29.24 
 
 
532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  28.6 
 
 
521 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  29.59 
 
 
505 aa  162  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  28.98 
 
 
539 aa  161  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  29.54 
 
 
522 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  28.69 
 
 
527 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  30.56 
 
 
547 aa  157  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  24.05 
 
 
597 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  27.1 
 
 
499 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  35.1 
 
 
300 aa  153  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  27.83 
 
 
514 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  28.18 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  28.16 
 
 
566 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  28.27 
 
 
493 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  29.38 
 
 
459 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  28 
 
 
494 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08498  proteinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01350)  26.22 
 
 
678 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.726549  normal  0.616517 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  33.78 
 
 
613 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  35.82 
 
 
597 aa  134  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  27.38 
 
 
517 aa  133  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  28.36 
 
 
536 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  27.52 
 
 
750 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  26.5 
 
 
524 aa  127  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 
525 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05429  conserved hypothetical protein  25.19 
 
 
600 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00467317  normal  0.0133715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  28.02 
 
 
559 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  28.75 
 
 
480 aa  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  27.2 
 
 
623 aa  120  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  34.96 
 
 
557 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  30.02 
 
 
524 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>