More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0886 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 236 aa  486  1e-136  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0500332 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  34.29 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.81 
 
 		 220 aa  95.1  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.84 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  33.48 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.1 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  30.65 
 
 		 247 aa  89  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  32.71 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.05 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.48 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.09 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.5 
 
 		 221 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.5 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  27.7 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  28.85 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  27.98 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  28.1 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.57 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.77 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  26.89 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  26.19 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  26.42 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  31.16 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  31.28 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  31.82 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  29.19 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  25.24 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.95 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  27.14 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.27 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  29.19 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  31.98 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  28.79 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  28.89 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  28.9 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.57 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.5 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.42 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.998223  normal  0.137923 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2291  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.99 
 
 		 218 aa  72  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.26 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  28.57 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.54 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.14 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0481  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.158536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  25.23 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  27.6 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.52 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.57 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  25.23 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.46 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.09 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.82 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  27.98 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1709  HAD family hydrolase  25.86 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1042  putative phosphoglycolate phosphatase protein  29.24 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0803838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  27.68 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.37 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1752  HAD family hydrolase  25.86 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000718269  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  27.14 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.23 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.23 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  24.56 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2800  HAD superfamily hydrolase  29.51 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00584417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2916  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.51 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0271792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2861  HAD superfamily hydrolase  29.51 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0565933  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1709  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.96 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0748768  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.63 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1880  HAD family hydrolase  36.24 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615565  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  28.33 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  28.8 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  25.93 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  26.46 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.01 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  27.01 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  26.07 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  22.83 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0258  phosphoglycolate phosphatase  27.03 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.691366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4225  phosphatase-like  30.43 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0633  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 219 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.32289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1113  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 219 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970841  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  26.34 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>