More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0060 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  77.24 
 
 
852 aa  1294  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  77.59 
 
 
852 aa  1300  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  76.89 
 
 
852 aa  1288  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
852 aa  1721  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  43.2 
 
 
804 aa  593  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  41.16 
 
 
818 aa  584  1e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.28316e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  39.38 
 
 
827 aa  568  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  41.07 
 
 
796 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  39.4 
 
 
829 aa  564  1e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.66752e-07 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  40.19 
 
 
841 aa  563  1e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  41.69 
 
 
802 aa  558  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  40.02 
 
 
818 aa  554  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  39.21 
 
 
773 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  38.58 
 
 
795 aa  541  1e-152  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  40.7 
 
 
797 aa  538  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.54529e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  41.18 
 
 
778 aa  527  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  38 
 
 
807 aa  495  1e-138  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  2.91309e-05 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  36.96 
 
 
807 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0293  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.95 
 
 
834 aa  491  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  36.32 
 
 
807 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  37.44 
 
 
862 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  38.77 
 
 
831 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3405  1A family penicillin-binding protein  40.54 
 
 
857 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379347  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  37.14 
 
 
804 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  36.45 
 
 
831 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  35.45 
 
 
843 aa  465  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  35.92 
 
 
809 aa  460  1e-128  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  35.75 
 
 
835 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  36.96 
 
 
833 aa  456  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  36.06 
 
 
830 aa  459  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  35.49 
 
 
812 aa  455  1e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  35.76 
 
 
748 aa  454  1e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  37.99 
 
 
908 aa  453  1e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  36.37 
 
 
846 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  37.12 
 
 
791 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  36.61 
 
 
830 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  36.08 
 
 
830 aa  447  1e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.37 
 
 
817 aa  448  1e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  36.17 
 
 
819 aa  449  1e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  35.6 
 
 
810 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  35.78 
 
 
832 aa  442  1e-122  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  35.48 
 
 
804 aa  442  1e-122  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  9.93377e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  34.69 
 
 
823 aa  440  1e-122  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  36.12 
 
 
838 aa  439  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  34.41 
 
 
818 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  35.38 
 
 
805 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  35.21 
 
 
803 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  36.74 
 
 
800 aa  432  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  35.94 
 
 
794 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  34.83 
 
 
791 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  35.46 
 
 
819 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  35.66 
 
 
803 aa  432  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  35.01 
 
 
808 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  34.13 
 
 
833 aa  429  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  35.51 
 
 
779 aa  427  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  34.61 
 
 
823 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3394  penicillin-binding protein, 1A family  38.67 
 
 
808 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.145767  normal  0.859795 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  34.24 
 
 
817 aa  429  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  34.09 
 
 
805 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  35.48 
 
 
818 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  36.22 
 
 
797 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  33.81 
 
 
805 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  35.49 
 
 
804 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  33.62 
 
 
794 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  34.61 
 
 
823 aa  426  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  34.95 
 
 
817 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  35.81 
 
 
804 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  33.66 
 
 
814 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  35.14 
 
 
819 aa  420  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  33.25 
 
 
794 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  35.02 
 
 
819 aa  419  1e-115  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0867  penicillin-binding protein 1A  34.87 
 
 
835 aa  417  1e-115  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371617  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  35.31 
 
 
830 aa  416  1e-115  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  34.08 
 
 
805 aa  417  1e-115  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 
814 aa  416  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  33.87 
 
 
815 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  34.71 
 
 
793 aa  413  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  34.83 
 
 
793 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  35.73 
 
 
849 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  33.45 
 
 
814 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  34.25 
 
 
817 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  34.16 
 
 
793 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  33.33 
 
 
777 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  33.74 
 
 
817 aa  409  1e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  35.09 
 
 
854 aa  407  1e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  33.74 
 
 
817 aa  409  1e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  34.19 
 
 
846 aa  408  1e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.62848e-07  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  35.07 
 
 
807 aa  407  1e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  34.09 
 
 
824 aa  406  1e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  35.41 
 
 
849 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  33.53 
 
 
819 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  35.79 
 
 
849 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  34.65 
 
 
845 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0319957 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  36.35 
 
 
803 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  33.21 
 
 
777 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  34.17 
 
 
797 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0607  penicillin-binding protein 1A  33.74 
 
 
839 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360567  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  33.21 
 
 
777 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1171  penicillin-binding protein  35.19 
 
 
840 aa  395  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0742026  normal  0.682279 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  32.51 
 
 
797 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>