257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1158 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 448 aa  887    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  61.99 
 
 		 456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  59.69 
 
 		 464 aa  465  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  58.5 
 
 		 463 aa  458  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  59.56 
 
 		 471 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  59.47 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  59.82 
 
 		 518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  59.96 
 
 		 455 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  57.08 
 
 		 507 aa  435  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  52.78 
 
 		 467 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  52.29 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  52.74 
 
 		 467 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  51.68 
 
 		 475 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  50.66 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  45.68 
 
 		 538 aa  370  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  48.55 
 
 		 546 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  45.7 
 
 		 548 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  47.18 
 
 		 549 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  46.39 
 
 		 552 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  48.64 
 
 		 552 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  45.6 
 
 		 547 aa  352  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  44.03 
 
 		 550 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 545 aa  349  5e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  46.28 
 
 		 552 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 		 545 aa  347  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  45.98 
 
 		 545 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  45.91 
 
 		 549 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  45.91 
 
 		 545 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  46.44 
 
 		 553 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  45.82 
 
 		 553 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  45.17 
 
 		 575 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  45.17 
 
 		 575 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  45.25 
 
 		 553 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  44.56 
 
 		 549 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  45.38 
 
 		 551 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  46.86 
 
 		 553 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  44.56 
 
 		 556 aa  337  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  46.23 
 
 		 554 aa  335  7e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  45.13 
 
 		 558 aa  332  7.000000000000001e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  46.54 
 
 		 552 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  46.03 
 
 		 553 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  46.03 
 
 		 553 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  46.25 
 
 		 537 aa  319  6e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  46.44 
 
 		 566 aa  318  9e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  44.96 
 
 		 556 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 570 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  40.19 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 412 aa  263  4e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 		 421 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  39.31 
 
 		 413 aa  257  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  36 
 
 		 411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  36.22 
 
 		 406 aa  216  5e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  34.72 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  36.6 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  34.47 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 415 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 425 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 421 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  32.42 
 
 		 938 aa  137  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 416 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  26.27 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  26.27 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  26.27 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 391 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  26.04 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  25.81 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  28.54 
 
 		 436 aa  123  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  27.84 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.54 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 454 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  27.2 
 
 		 455 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 407 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 431 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 465 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0904  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 422 aa  103  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  38.76 
 
 		 679 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  26.18 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  23.44 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  23.44 
 
 		 402 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>