129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1720 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
239 aa  476  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  35.56 
 
 
252 aa  98.6  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  34.58 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  33.21 
 
 
276 aa  92  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  32.92 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  32.82 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  31.47 
 
 
279 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  30.83 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  29.61 
 
 
256 aa  85.5  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  31.15 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  33.2 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  30.74 
 
 
262 aa  81.6  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  28.38 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1451  protein tyrosine/serine phosphatase  32.49 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1584  protein tyrosine/serine phosphatase  32.55 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  30.92 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  29.27 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0735  protein tyrosine/serine phosphatase  30 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2202  protein tyrosine/serine phosphatase  30.42 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534636  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  27.59 
 
 
265 aa  71.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  27.17 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  27.17 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  28.2 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  27.17 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356676 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  27.31 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  28.69 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  31.6 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  27.46 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45376  predicted protein  36.19 
 
 
490 aa  69.3  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.88052  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  27.59 
 
 
283 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  29.64 
 
 
262 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  28.38 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  26.77 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  27.07 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  24.15 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  31.15 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  29.74 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  34.09 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  24.71 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  31.62 
 
 
257 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  30 
 
 
260 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  30.24 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  25.5 
 
 
260 aa  62.4  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  27.43 
 
 
280 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  35.19 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  25.71 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  26.88 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  25.45 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0661  protein tyrosine/serine phosphatase  29.41 
 
 
244 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  27.31 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  26.56 
 
 
316 aa  59.3  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  27.74 
 
 
270 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  31.58 
 
 
274 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2407  protein tyrosine/serine phosphatase  29.58 
 
 
228 aa  58.9  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1765  protein tyrosine/serine phosphatase  31.33 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  29.17 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  27.78 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  30.43 
 
 
277 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1285  protein tyrosine/serine phosphatase  30.29 
 
 
289 aa  56.2  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00000171283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  28.77 
 
 
279 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  23.39 
 
 
267 aa  55.8  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  28.46 
 
 
265 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  29.27 
 
 
349 aa  55.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  25.88 
 
 
636 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24750  protein tyrosine/serine phosphatase  28.21 
 
 
315 aa  55.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606708  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0624  protein tyrosine/serine phosphatase  26.6 
 
 
276 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  30.32 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  28.09 
 
 
269 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  25.4 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  24.59 
 
 
637 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34732  predicted protein  33.07 
 
 
309 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0245742  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  25.84 
 
 
671 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  28.67 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  29.8 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  25.1 
 
 
332 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  24.72 
 
 
263 aa  52.4  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  36.26 
 
 
260 aa  52  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  26.64 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  45.95 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  27.16 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0412  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270041  hitchhiker  0.00092247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.32 
 
 
340 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0236  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.32 
 
 
340 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.32 
 
 
340 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.32 
 
 
340 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  25.91 
 
 
342 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  28 
 
 
264 aa  50.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  45.45 
 
 
270 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  26.32 
 
 
340 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  34.07 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09355  conserved hypothetical protein  28.91 
 
 
278 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543229  normal  0.0103312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 
250 aa  48.9  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  25.1 
 
 
340 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  31.25 
 
 
269 aa  48.9  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3477  protein tyrosine/serine phosphatase  28.7 
 
 
245 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  30.22 
 
 
265 aa  48.5  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  28.57 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  25.1 
 
 
339 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>