More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0074 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0074  Patatin  100 
 
 		 283 aa  554  1e-157  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  40.15 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  36.3 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  37.45 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  36.33 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  40.51 
 
 		 277 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  37.89 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  35.69 
 
 		 312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  36.43 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  37.77 
 
 		 277 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  35.88 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  35.91 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  35.91 
 
 		 306 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  36.92 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  46.77 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  35.56 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  33.73 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  35.94 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  37.5 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  35.2 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0014  patatin  31.11 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  30.74 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  32.82 
 
 		 357 aa  99.4  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  36.49 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  27.13 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  33.15 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  28.01 
 
 		 727 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  27.6 
 
 		 728 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  27.3 
 
 		 728 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  27.3 
 
 		 728 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  28.83 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  28.83 
 
 		 320 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  28.83 
 
 		 320 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  29.39 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  26.95 
 
 		 751 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  27.11 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  28.21 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  25.5 
 
 		 315 aa  85.9  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  30 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  32.04 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  27.54 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  31.25 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  27.84 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  26.23 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  32.07 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  26.89 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  22.64 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  27.17 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  26.47 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  29.59 
 
 		 728 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  31.05 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  32.64 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  31.58 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  27.76 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  29.6 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  24.5 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  30.56 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  27 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  28.29 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  24.64 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.07 
 
 		 624 aa  79  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  32.54 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  25.69 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  32.54 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  22.79 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  26.34 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  25.76 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  26.42 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  29.11 
 
 		 728 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  30.32 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  25 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  28.51 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  25.89 
 
 		 733 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  28.7 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  31.03 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  29.85 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  31.34 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  25.09 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  28.35 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  30.99 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  27.56 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  27.08 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  26.02 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  27.71 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  28.08 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  31.31 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  31.31 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  22.94 
 
 		 740 aa  75.1  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  27.68 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  29.23 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  25.1 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  29.23 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  24.73 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.18 
 
 		 757 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  23.88 
 
 		 741 aa  74.7  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  31.67 
 
 		 583 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  25.32 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  30.18 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  27.32 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  27.37 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>