More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2963 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  100 
 
 
213 aa  424  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  48.69 
 
 
210 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  38.65 
 
 
208 aa  158  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  44.83 
 
 
209 aa  157  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  45.63 
 
 
206 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  42.08 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  42.08 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  39.05 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  39.71 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  40.29 
 
 
207 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  37.69 
 
 
212 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  38.65 
 
 
207 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  40.59 
 
 
215 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  41.4 
 
 
188 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  43.1 
 
 
183 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  41.09 
 
 
208 aa  142  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  39.7 
 
 
211 aa  141  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  39.09 
 
 
218 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  40.84 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  38.69 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  36.89 
 
 
214 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  37.37 
 
 
202 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  35.78 
 
 
229 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  31.05 
 
 
192 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
379 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  31.05 
 
 
192 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  31.05 
 
 
192 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  39.88 
 
 
281 aa  88.6  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  32.46 
 
 
379 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  32.46 
 
 
379 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.46 
 
 
379 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  30.67 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  32.46 
 
 
379 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.46 
 
 
379 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  32.46 
 
 
379 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.46 
 
 
379 aa  87.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.46 
 
 
379 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  32.98 
 
 
317 aa  86.3  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  31.94 
 
 
379 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.94 
 
 
348 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.94 
 
 
379 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.94 
 
 
348 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.94 
 
 
379 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.94 
 
 
351 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  31.79 
 
 
227 aa  85.5  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  38.27 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.9 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  30.41 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  33.7 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  33.7 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  33.7 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  33.7 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  33.7 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  33.7 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  33.7 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  31.25 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  33.15 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  33.52 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  31.9 
 
 
362 aa  82  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  31.84 
 
 
388 aa  81.6  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  29.7 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  34.76 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  31.61 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  29.76 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  30.93 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  30 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  29.12 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  31.52 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  31.71 
 
 
270 aa  79  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  30.37 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  31.58 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  30.91 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  30.81 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  30.46 
 
 
386 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  30.36 
 
 
387 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  33.53 
 
 
376 aa  75.9  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  30.3 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  31.13 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  37.13 
 
 
268 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  28.25 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  30.25 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.8 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  31.43 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  30.39 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  29.15 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.66 
 
 
396 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  31.5 
 
 
392 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  32.66 
 
 
391 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  32.66 
 
 
391 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  29.82 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  31.5 
 
 
387 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  31.5 
 
 
387 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  32 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  30.56 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  30.93 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  31.16 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  29.83 
 
 
495 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  29.83 
 
 
495 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  30.86 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  30.51 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>