55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2837 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
529 aa  1048    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  36.97 
 
 
531 aa  259  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  35.73 
 
 
532 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  42.3 
 
 
533 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  45.45 
 
 
525 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  43.69 
 
 
521 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  45.45 
 
 
521 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  35.28 
 
 
538 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  43.67 
 
 
522 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  35.73 
 
 
558 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  36.32 
 
 
536 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  36.09 
 
 
541 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  33.47 
 
 
494 aa  239  9e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  35.2 
 
 
558 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  38.82 
 
 
869 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  34.05 
 
 
650 aa  224  4e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 
863 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  35.52 
 
 
862 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  43.84 
 
 
540 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  41.95 
 
 
541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  35.01 
 
 
863 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  33.56 
 
 
638 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  35.01 
 
 
863 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
885 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 
903 aa  212  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  36.29 
 
 
863 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  40.07 
 
 
868 aa  210  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 
917 aa  209  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  30.04 
 
 
535 aa  209  9e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 
859 aa  200  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
889 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
899 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  38.11 
 
 
905 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  39.04 
 
 
895 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 
919 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  34.99 
 
 
895 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  36.58 
 
 
889 aa  187  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 
831 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.4 
 
 
842 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
944 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  30.98 
 
 
844 aa  170  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
889 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  31.09 
 
 
295 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  31.18 
 
 
295 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74722  Glycoside hydrolase, family 17  27.84 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154228  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  22.4 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03727  putative beta transglucosylase, GH17 family (Eurofung)  25.57 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  21.84 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  25.58 
 
 
555 aa  66.6  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10150  Putative beta-transglucosylase. Family GH17. A fumigatus Bgt1-like (Eurofung)  25.81 
 
 
304 aa  63.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251061  normal  0.119691 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32120  family 17 glucosidase SCW11 precursor (Soluble cell wall protein 11)  25 
 
 
452 aa  57  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.506951  normal  0.0756506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0507  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  26.44 
 
 
338 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04700  Endo-beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B430]  23.32 
 
 
649 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361112  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57025  cell wall glucanase Probable family 17 glucosidase SCW4 precursor (Soluble cell wall protein 4)  20.74 
 
 
303 aa  50.4  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277446  normal  0.953702 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89695  Soluble Cell Wall protein  21.98 
 
 
369 aa  44.3  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>