More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4414 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
413 aa  822    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  34.39 
 
 
406 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  34.06 
 
 
405 aa  229  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 
406 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  35.54 
 
 
400 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  33.92 
 
 
391 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  35.47 
 
 
402 aa  219  8.999999999999998e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  32.59 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  32.83 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  32.92 
 
 
407 aa  209  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  33.99 
 
 
405 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  33.99 
 
 
405 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  33.01 
 
 
405 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  31.78 
 
 
405 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  30.81 
 
 
406 aa  207  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  30.17 
 
 
406 aa  206  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 
405 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  33.58 
 
 
405 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  35.47 
 
 
397 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  32.86 
 
 
409 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  32.86 
 
 
409 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  32.46 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  30.44 
 
 
657 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  32.58 
 
 
392 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  32.62 
 
 
657 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  32.68 
 
 
409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  32.38 
 
 
409 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 
409 aa  196  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  32.54 
 
 
409 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.8 
 
 
649 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.8 
 
 
649 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  32.6 
 
 
405 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  32.36 
 
 
405 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  33.66 
 
 
405 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  30.77 
 
 
653 aa  194  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  29.27 
 
 
656 aa  194  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  32.27 
 
 
409 aa  193  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  31.99 
 
 
644 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  32.15 
 
 
414 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  32.99 
 
 
657 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  30.46 
 
 
411 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  33.83 
 
 
398 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.99 
 
 
648 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  34.88 
 
 
653 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.1 
 
 
646 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  30.39 
 
 
412 aa  189  9e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  31.46 
 
 
410 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  32.92 
 
 
404 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  31.58 
 
 
403 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  33.58 
 
 
401 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.61 
 
 
648 aa  186  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  32.27 
 
 
401 aa  186  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  31.48 
 
 
443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  33.18 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  31.22 
 
 
410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  32.37 
 
 
648 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  32.37 
 
 
648 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  32.86 
 
 
415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  34.05 
 
 
404 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.37 
 
 
648 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.37 
 
 
648 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  34.05 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  32.37 
 
 
648 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  33.66 
 
 
668 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.13 
 
 
648 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.37 
 
 
648 aa  184  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  30.92 
 
 
403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  32.08 
 
 
402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0469  protein of unknown function DUF214  32.35 
 
 
405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  32.3 
 
 
417 aa  183  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  33.89 
 
 
410 aa  183  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  29.98 
 
 
409 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  31.63 
 
 
681 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  31.16 
 
 
663 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  30.49 
 
 
648 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  31.18 
 
 
411 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  31.63 
 
 
681 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  30.17 
 
 
658 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  32.19 
 
 
678 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.19 
 
 
678 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  32.64 
 
 
418 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  32.24 
 
 
651 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  31.74 
 
 
398 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  29.64 
 
 
409 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  30.68 
 
 
410 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  32.15 
 
 
400 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  30.9 
 
 
654 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  32.19 
 
 
678 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  29.34 
 
 
409 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  31.86 
 
 
408 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  31.7 
 
 
657 aa  181  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  32.38 
 
 
385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  31.98 
 
 
656 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  31.81 
 
 
687 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  31.16 
 
 
670 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  32.32 
 
 
656 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  32.08 
 
 
653 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  34.15 
 
 
395 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  31.7 
 
 
400 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0223  hypothetical protein  33.99 
 
 
401 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0103293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>