131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0210 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  260  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  53.39 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  50.43 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  51.26 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  49.58 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  46.61 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  45.61 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5182  transcriptional repressor, CopY family  46.09 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717917  hitchhiker  0.0058899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  38.02 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  36.13 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  31.93 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  34.15 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  27.05 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  28.07 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  26.32 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  27.19 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  21.19 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  23.01 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  31.09 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  33.33 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  25 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  31.03 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  22.81 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  21.93 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  21.93 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  26.96 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  21.19 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  21.19 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  24.79 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  21.55 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0677  penicillinase repressor  28.45 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  25.66 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  36.9 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  28.81 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  28.07 
 
 		 169 aa  51.6  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  23.93 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  30.09 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  26.09 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  32.46 
 
 		 129 aa  50.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  26.96 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  26.96 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  21.19 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  23.15 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  30.77 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  27.73 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  30.77 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  28.33 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  29.09 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  28.7 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  26.55 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  25 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  25.83 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  30.53 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  29.46 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2142  CopY family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.325229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  25.62 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  25.86 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  27.59 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  24.14 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  23.08 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  31.36 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  27.12 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  23.14 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0076  transcriptional repressor, CopY family  23.48 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726818  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  24.32 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3145  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  35.65 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  27.12 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>