More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1941 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 412 aa  811    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  55.16 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  50.75 
 
 		 409 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  51.76 
 
 		 625 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  49.88 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  50.85 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  54.8 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  50.39 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  53.13 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  50.87 
 
 		 442 aa  368  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  52.44 
 
 		 396 aa  359  6e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  49.33 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  50.53 
 
 		 408 aa  348  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  41.83 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  48.47 
 
 		 396 aa  339  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  41.34 
 
 		 402 aa  335  7e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  48.66 
 
 		 399 aa  335  7e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 		 400 aa  333  5e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  44.75 
 
 		 410 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  50.39 
 
 		 395 aa  329  7e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  43.61 
 
 		 409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  44.3 
 
 		 397 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  46.06 
 
 		 403 aa  325  9e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  44.5 
 
 		 410 aa  324  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  48.13 
 
 		 399 aa  323  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  41.56 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  41.39 
 
 		 404 aa  315  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  42.49 
 
 		 404 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  41.28 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  48.31 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  40.16 
 
 		 407 aa  310  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  47.61 
 
 		 402 aa  308  8e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  44.95 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  43.69 
 
 		 397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  40 
 
 		 400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  46.27 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  44.44 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  44.62 
 
 		 400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  44.44 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  38.38 
 
 		 400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  44.44 
 
 		 398 aa  302  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  40.78 
 
 		 407 aa  299  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  40.15 
 
 		 422 aa  299  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  43.12 
 
 		 425 aa  299  6e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  40.15 
 
 		 422 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  39.9 
 
 		 422 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  39.9 
 
 		 422 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  39.64 
 
 		 422 aa  296  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  39.9 
 
 		 422 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  39.9 
 
 		 422 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  39.9 
 
 		 422 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  41.87 
 
 		 416 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  39.64 
 
 		 422 aa  293  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  42.02 
 
 		 416 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  41.6 
 
 		 416 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  40.67 
 
 		 398 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  45.63 
 
 		 396 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  40.32 
 
 		 422 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  40.05 
 
 		 422 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  38.73 
 
 		 410 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  40.05 
 
 		 422 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  39.79 
 
 		 422 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  39.79 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  37.89 
 
 		 408 aa  282  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  40.05 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  38.5 
 
 		 399 aa  278  9e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  41.12 
 
 		 400 aa  278  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  35.13 
 
 		 416 aa  271  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  37.72 
 
 		 403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  39.09 
 
 		 405 aa  219  7.999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 		 406 aa  206  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  36.44 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 408 aa  189  5e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  34.44 
 
 		 409 aa  189  9e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 405 aa  176  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  34.83 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  40.34 
 
 		 245 aa  172  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  32.53 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  32.43 
 
 		 368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 366 aa  156  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 375 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 363 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 368 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 		 368 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  33.44 
 
 		 371 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  30.48 
 
 		 371 aa  139  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  36.48 
 
 		 366 aa  139  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  38.17 
 
 		 366 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 378 aa  139  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>