More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0722 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
456 aa  926    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1719  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.96 
 
 
443 aa  248  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2006  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.72 
 
 
455 aa  239  8e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  33.86 
 
 
445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.98 
 
 
474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.09 
 
 
458 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.85 
 
 
458 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.38 
 
 
458 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.28 
 
 
458 aa  227  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.58 
 
 
443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.01 
 
 
437 aa  210  4e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.41 
 
 
470 aa  204  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.12 
 
 
454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4478  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.72 
 
 
465 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.54 
 
 
485 aa  196  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  29.85 
 
 
466 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1846  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.17 
 
 
459 aa  190  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0233195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0283  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.52 
 
 
464 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.52 
 
 
454 aa  186  8e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30 
 
 
463 aa  186  8e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2489  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.98 
 
 
463 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3619  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.98 
 
 
463 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3911  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.39 
 
 
467 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.484753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3456  DNA gyrase modulator peptidase U62  31.36 
 
 
464 aa  180  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.258485  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.66 
 
 
483 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1293  TldD/PmbA family protein  30.04 
 
 
460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00519979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.73 
 
 
489 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.41 
 
 
458 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.19 
 
 
461 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.19 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  28.57 
 
 
486 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.18 
 
 
460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.34 
 
 
486 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 
460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  28.12 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.19 
 
 
460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.29 
 
 
458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.34 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.52 
 
 
444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.08 
 
 
473 aa  163  7e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  28.37 
 
 
445 aa  160  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  29.27 
 
 
460 aa  159  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.77 
 
 
457 aa  157  4e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  28.23 
 
 
460 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.21 
 
 
497 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.45 
 
 
464 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.93 
 
 
464 aa  154  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.7 
 
 
442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  34.72 
 
 
474 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.7 
 
 
462 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  28.45 
 
 
467 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  33.96 
 
 
461 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.73 
 
 
471 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.95 
 
 
462 aa  151  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.87 
 
 
476 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_002978  WD0998  tldD protein  30.52 
 
 
472 aa  150  4e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.555962  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.72 
 
 
464 aa  150  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0640  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.15 
 
 
471 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481365 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.65 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.51 
 
 
475 aa  147  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  35.94 
 
 
470 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0505  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.93 
 
 
471 aa  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1036  TldD  29.13 
 
 
471 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  27.79 
 
 
480 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.46 
 
 
462 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.62 
 
 
481 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  28.1 
 
 
475 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.56 
 
 
459 aa  144  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  27 
 
 
480 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  35.23 
 
 
470 aa  143  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  27 
 
 
480 aa  143  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3429  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.87 
 
 
489 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.88 
 
 
470 aa  143  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2687  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.87 
 
 
489 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2754  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.54 
 
 
489 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1127  microcin-processing peptidase 2  26.32 
 
 
489 aa  142  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.78 
 
 
469 aa  142  9e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.38 
 
 
477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  29.1 
 
 
471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  33.86 
 
 
497 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  33.86 
 
 
497 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  33.86 
 
 
497 aa  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.86 
 
 
490 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10261  putative modulator of DNA gyrase; TldD  27.01 
 
 
474 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  28.41 
 
 
481 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.42 
 
 
457 aa  139  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.05 
 
 
477 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  28.04 
 
 
474 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  27.45 
 
 
490 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.08 
 
 
490 aa  138  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.2 
 
 
482 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.11 
 
 
459 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0364  putative modulator of DNA gyrase; TldD  28.07 
 
 
469 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10461  putative modulator of DNA gyrase; TldD  28.07 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157688  hitchhiker  0.0011828 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.95 
 
 
465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.82 
 
 
480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.46 
 
 
482 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  28.14 
 
 
477 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4592  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.76 
 
 
475 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647978  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  33.07 
 
 
482 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>