More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1403 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  80.46 
 
 
395 aa  663    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  82.03 
 
 
395 aa  676    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  100 
 
 
395 aa  804    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  82.53 
 
 
395 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  79.44 
 
 
395 aa  654    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  75.7 
 
 
395 aa  634  1e-180  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1936  elongation factor Tu  75.95 
 
 
395 aa  623  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1212  elongation factor Tu  77.72 
 
 
395 aa  619  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1700  translation elongation factor Tu  76.65 
 
 
395 aa  607  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00060  translation elongation factor Tu  74.68 
 
 
395 aa  607  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.937819  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  74.94 
 
 
395 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  74.94 
 
 
395 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  73.03 
 
 
394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  71.83 
 
 
395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0840  translation elongation factor Tu  76.88 
 
 
398 aa  597  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1101  translation elongation factor Tu  76.88 
 
 
398 aa  597  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000113146  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  70.68 
 
 
399 aa  594  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  72.47 
 
 
396 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  72.47 
 
 
396 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  70.74 
 
 
395 aa  593  1e-168  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  69.92 
 
 
399 aa  591  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  72.47 
 
 
396 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  72.47 
 
 
396 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  72.01 
 
 
396 aa  592  1e-168  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  72.91 
 
 
396 aa  592  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  72.15 
 
 
394 aa  588  1e-167  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  71.72 
 
 
396 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  69.67 
 
 
399 aa  590  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  71.72 
 
 
396 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  71.86 
 
 
400 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  72.25 
 
 
400 aa  585  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  73.12 
 
 
397 aa  585  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  72.66 
 
 
395 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  71.86 
 
 
400 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  73.12 
 
 
397 aa  585  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  72.25 
 
 
400 aa  585  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2054  elongation factor Tu  73.28 
 
 
395 aa  585  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00228831  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  70.23 
 
 
396 aa  584  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1672  elongation factor Tu  71.68 
 
 
399 aa  585  1e-166  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000990168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  70.32 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  69.25 
 
 
400 aa  581  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  69.25 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  71.9 
 
 
395 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  70.32 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  69.25 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  70.3 
 
 
394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  70.3 
 
 
394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  70.3 
 
 
394 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  70.3 
 
 
394 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  70.6 
 
 
400 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  70.28 
 
 
397 aa  580  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  70.71 
 
 
397 aa  577  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  70.6 
 
 
400 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  70.28 
 
 
397 aa  580  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  68.92 
 
 
399 aa  579  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  68.42 
 
 
399 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  68.42 
 
 
399 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  70.3 
 
 
394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  69.95 
 
 
396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2066  elongation factor Tu  72.66 
 
 
393 aa  574  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000429802  normal  0.421241 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  70.25 
 
 
400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  72.47 
 
 
396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  72.47 
 
 
396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2231  elongation factor Tu  73.42 
 
 
393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000169519  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  69.95 
 
 
396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  69.08 
 
 
400 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  68.42 
 
 
399 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  72.66 
 
 
395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  68.59 
 
 
400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  68.94 
 
 
397 aa  574  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0190  translation elongation factor Tu  69.87 
 
 
394 aa  571  1.0000000000000001e-162  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  69 
 
 
400 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  70.3 
 
 
394 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  70.03 
 
 
396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  70.78 
 
 
396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1853  elongation factor Tu  73.54 
 
 
393 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000429764  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  69.5 
 
 
399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1054  translation elongation factor Tu  69.87 
 
 
394 aa  571  1.0000000000000001e-162  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  70.78 
 
 
396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0287  elongation factor Tu  72.66 
 
 
393 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118112  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  69.77 
 
 
396 aa  571  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  70.05 
 
 
394 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  70.05 
 
 
394 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  68.59 
 
 
400 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  70.13 
 
 
397 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  69.27 
 
 
396 aa  568  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2859  elongation factor Tu  72.04 
 
 
396 aa  568  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2871  elongation factor Tu  72.04 
 
 
396 aa  568  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.373737  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  69.77 
 
 
396 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  69.77 
 
 
396 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  70.18 
 
 
399 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  70.89 
 
 
396 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  68.26 
 
 
397 aa  569  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1338  translation elongation factor Tu  72.59 
 
 
394 aa  570  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  69.77 
 
 
396 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  69.6 
 
 
396 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  70.89 
 
 
396 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  69.77 
 
 
396 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  70.03 
 
 
396 aa  570  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  69.6 
 
 
396 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>