More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00060 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  79.49 
 
 		 395 aa  657    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  78.73 
 
 		 395 aa  670    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1212  elongation factor Tu  86.84 
 
 		 395 aa  687    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1936  elongation factor Tu  87.09 
 
 		 395 aa  723    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  77.92 
 
 		 395 aa  640    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  80 
 
 		 395 aa  662    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  79.95 
 
 		 395 aa  662    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00060  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 395 aa  807    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.937819  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  74.68 
 
 		 395 aa  626  1e-178  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1700  translation elongation factor Tu  75.63 
 
 		 395 aa  600  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  70.13 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  69.02 
 
 		 397 aa  590  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 397 aa  584  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 397 aa  584  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  68.5 
 
 		 400 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  69.19 
 
 		 397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  68.53 
 
 		 395 aa  581  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  70.3 
 
 		 394 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  70.3 
 
 		 394 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  69.27 
 
 		 397 aa  578  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  67.68 
 
 		 397 aa  580  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  68.92 
 
 		 399 aa  577  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  69.27 
 
 		 397 aa  578  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  69.17 
 
 		 399 aa  580  1e-164  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  68.18 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 395 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  66.5 
 
 		 400 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  68.18 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  67.68 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  68.18 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  71.39 
 
 		 395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  66.75 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  68.18 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  69.11 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  69.8 
 
 		 394 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  67.84 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  66.41 
 
 		 397 aa  574  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  67.93 
 
 		 397 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  67.59 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  68.18 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  67.67 
 
 		 399 aa  571  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  67.67 
 
 		 399 aa  571  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  67.94 
 
 		 394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  69.19 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  68.26 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0840  translation elongation factor Tu  73.12 
 
 		 398 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  68.17 
 
 		 399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  67.92 
 
 		 399 aa  571  1.0000000000000001e-162  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  68.25 
 
 		 400 aa  573  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  69.02 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  69.02 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  67.67 
 
 		 399 aa  571  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0603  elongation factor Tu  72.34 
 
 		 394 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00291328  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3996  elongation factor Tu  72.34 
 
 		 394 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000528557  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  69.54 
 
 		 394 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  67.84 
 
 		 400 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  67.67 
 
 		 399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  67.94 
 
 		 396 aa  571  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  69.19 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  68.26 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  68.35 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  67.09 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  66.83 
 
 		 400 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  67.76 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  66.83 
 
 		 400 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  67.51 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  68 
 
 		 400 aa  568  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  67.09 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  69.19 
 
 		 397 aa  568  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  67.51 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  67.51 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  67.76 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  66.75 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  68 
 
 		 400 aa  568  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  67.51 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  66.75 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  68.01 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1101  translation elongation factor Tu  72.86 
 
 		 398 aa  570  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000113146  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  67.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  67.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  67.09 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  67.09 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  66.83 
 
 		 400 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  69.19 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775684  hitchhiker  0.000000000148389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  66.83 
 
 		 400 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  67 
 
 		 400 aa  570  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  67.34 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  68.69 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  66.75 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  68.69 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  68.1 
 
 		 395 aa  565  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  66.75 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>