More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1700 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  79.7 
 
 		 395 aa  655    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  79.49 
 
 		 395 aa  650    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1700  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 395 aa  801    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  79.7 
 
 		 395 aa  656    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  78.73 
 
 		 395 aa  651    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  76.65 
 
 		 395 aa  630  1e-179  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  74.87 
 
 		 395 aa  622  1e-177  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1936  elongation factor Tu  74.18 
 
 		 395 aa  615  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  75.38 
 
 		 394 aa  617  1e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1212  elongation factor Tu  77.41 
 
 		 395 aa  609  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  72.66 
 
 		 395 aa  608  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00060  translation elongation factor Tu  75.63 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.937819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 402 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  73.55 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  73.55 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  72.26 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  73.3 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  73.38 
 
 		 402 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  74.24 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  74.24 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  73.67 
 
 		 395 aa  598  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  73.67 
 
 		 395 aa  598  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  73.3 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  72 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  73.55 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  71 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  73.55 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  73.55 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  73.55 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  73.48 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  73.48 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  74.43 
 
 		 395 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  73.99 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  73.99 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  73.55 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  73.55 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775684  hitchhiker  0.000000000148389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  73.55 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  73.55 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  73.55 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  73.55 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 395 aa  593  1e-168  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  73.67 
 
 		 395 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0048  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000026192  decreased coverage  9.37064e-25 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 399 aa  590  1e-167  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  71.54 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  71.54 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>